Infections gastro-intestinales
- >200 millions d’épisodes/an de gastro-entérite infectieuse aux États-unis1
- Dans le monde, 3 à 6 millions d’enfants meurent chaque année de gastro-entérite infectieuse2
- Les épidémies d’infections gastro-intestinales sont une grave préoccupation en milieu hospitalier
Définition
Les infections gastro-intestinales sont des infections virales, bactériennes ou parasitaires qui provoquent une gastro-entérite, une inflammation de le tractus gastro-intestinal impliquant à la fois l’estomac et l’intestin grêle. Les symptômes comprennent la diarrhée, des vomissements et des douleurs abdominales. La déshydratation est le principal danger des infections gastro-intestinales, la réhydratation est donc importante, mais la plupart des infections gastro-intestinales sont auto-limitées et disparaissent en quelques jours. Cependant, dans un cadre de santé et dans des populations spécifiques (nouveau-nés / nourrissons, patients immunodéprimés ou populations âgées), ils sont potentiellement graves. Un diagnostic rapide, un traitement approprié et des mesures de contrôle des infections sont donc particulièrement importants dans ces contextes.
Les infections gastro-intestinales peuvent être causées par un grand nombre de microorganismes, notamment:
Adénovirus
L’adénovirus peut causer de la diarrhée, de la fièvre, une conjonctivite, des infections de la vessie et des éruptions cutanées, mais le symptôme le plus courant est une maladie respiratoire. Après le rotavirus, c’est la cause la plus fréquente de diarrhée pédiatrique.
Campylobacter
Campylobacter est l’une des causes bactériennes les plus courantes de gastro-entérite dans le monde et est fréquente chez les enfants de moins de deux ans. Il peut provoquer des diarrhées (parfois sanglantes), des crampes abdominales, des vomissements et de la fièvre. Il est généralement d’origine alimentaire par la viande crue ou insuffisamment cuite (en particulier la volaille) ou par le lait contaminé.
Clostridium difficile
L’infection à Clostridium difficile est responsable de jusqu’à 25% des cas de diarrhée associée aux antibiotiques le plus souvent contractée dans les hôpitaux ou les établissements de santé3. Les patients âgés et immunodéprimés sont les plus à risque. L’émergence récente de souches de C. difficile hautement toxigènes et résistantes a entraîné des éclosions plus fréquentes et plus graves, ainsi qu’une augmentation de la morbidité et de la mortalité.
Escherichia coli
Escherichia coli, souvent appelée E. coli, est la principale cause de diarrhée des voyageurs et une cause majeure de maladies diarrhéiques dans les pays en développement, en particulier chez les enfants. Les gens contractent généralement E. coli par ingestion d’eau contaminée par des excréments humains ou animaux.
Escherichia coli O157: H7
Escherichia coli O157:H7 est une forme productrice de Shiga toxine de la bactérie E. coli, qui provoque des infections gastro-intestinales avec des symptômes comprenant une diarrhée sanglante et des vomissements. Bien qu’il se résorbe généralement après quelques jours, il peut parfois (5 à 10% 4 des infections) entraîner un syndrome hémolytique et urémique (SHU), qui peut entraîner une insuffisance rénale s’il n’est pas traité.
Helicobacter pylori
Helicobacter pylori, appelé H. pylori, est une cause de gastrite et est associé au développement d’ulcères gastriques et duodénaux. Il peut causer des douleurs à l’estomac ou des nausées, mais dans de nombreux cas, il n’y a pas de symptômes. Les personnes infectées ont un risque à vie de 10 à 20% de développer des ulcères gastro-duodénaux et un risque de cancer de l’estomac de 1 à 2% 5.
Rotavirus
Le rotavirus est la cause la plus fréquente de diarrhée chez les jeunes enfants et les nourrissons et il est responsable des cas les plus graves. Il existe un vaccin contre le rotavirus, mais à l’échelle mondiale, il provoque plus de ½ million de décès par an chez les enfants de moins de cinq ans.6 La plupart d’entre eux se trouvent dans des pays émergents.
Salmonella et Shigella
Salmonella et Shigella sont des maladies gastro-intestinales d’origine alimentaire. La salmonelle est commune et se trouve dans les viandes crues, la volaille, les fruits de mer et les œufs, ainsi que le lait et les produits laitiers. Les symptômes aigus comprennent des nausées, des vomissements, des crampes abdominales, de la diarrhée, de la fièvre et des maux de tête. Shigella se trouve fréquemment dans l’eau polluée par les excréments humains. Les symptômes de la shigellose (dysenterie bacillaire) comprennent des douleurs abdominales, des crampes, de la diarrhée, de la fièvre, des vomissements et du sang, du pus ou du mucus dans les selles.
Staphylococcus aureus
Staphylococcus aureus est la cause la plus fréquente d’intoxication alimentaire, caractérisée par un début brusque / violent, des nausées sévères, des crampes, des vomissements et une diarrhée pendant 1 à 2 jours. Cet agent pathogène opportuniste peut être trouvé sur les humains (peau, coupures infectées, nez et gorge) et a été associé à un large éventail d’aliments, y compris la viande et les produits carnés, la volaille et les ovoproduits, les salades, les produits de boulangerie et les produits laitiers.
Yersinia enterocolitica
Yersinia enterocolitica, appelée Y. l’entérocolitique est une cause relativement peu fréquente de diarrhée et de douleurs abdominales. L’infection est le plus souvent acquise en mangeant des aliments contaminés, en particulier des produits de porc crus ou insuffisamment cuits, ainsi que des glaces et du lait. Les symptômes courants sont la fièvre, les douleurs abdominales et la diarrhée, souvent sanglante.
Diagnostic
Lorsque les symptômes indiquent une infection gastro-intestinale possible, le diagnostic peut être confirmé par des tests de laboratoire utilisés pour la culture ou la détection d’antigènes à partir d’échantillons de selles. Dans certains cas (p. ex. pour E. coli, Salmonella, C. difficile …), un test de sensibilité aux antibiotiques est utilisé pour déterminer la résistance microbienne à l’antibiothérapie, le cas échéant. En particulier en milieu hospitalier, le diagnostic rapide fournit des informations importantes pour la mise en œuvre de mesures de contrôle des infections.
Pour diagnostiquer la cause d’une diarrhée, il est utile de considérer le contexte d’une épidémie d’origine alimentaire ou d’une « diarrhée des voyageurs”.
Éclosions d’origine alimentaire:
- Souvent locales – un groupe de personnes mangeant ensemble souffre de la même maladie.
- Un problème de santé publique lorsqu’il est généralisé, affectant des personnes à différents endroits et sur une plus longue période.
- Important de reconnaître et de suivre épidémiologiquement, pour éviter que plus de personnes soient infectées.
- E. coli, Salmonella, Campylobacter et Staphylococcus sont parmi les agents pathogènes les plus courants causant des épidémies d’origine alimentaire.
Diarrhée des voyageurs:
- Maladie liée aux voyages la plus fréquente.
- Contractées par des personnes voyageant dans des endroits où il existe des agents pathogènes différents de ceux auxquels elles sont habituées, en particulier dans les régions où la contamination des aliments et de l’eau est plus répandue.
- Le plus souvent transmis par ingestion d’aliments ou d’eau contaminés par des matières fécales.
- La plupart des cas causés par des bactéries, y compris E. coli, Salmonella et Shigella.
Prévention / traitement
Les meilleurs moyens de prévenir les infections gastro-intestinales comprennent:
- Lavage approprié des mains
- Désinfection des surfaces contaminées avec de l’eau de Javel
- Lavage des vêtements souillés
- Identification des patients infectés dès que possible pour mettre en œuvre un contrôle prolongé de l’infection
- Il n’existe aucun vaccin contre la plupart des infections gastro-intestinales. Exceptions:
- Rotavirus
- Adénovirus (disponibilité limitée)
- Pour C. difficile: évitez de prescrire inutilement des antibiotiques
Les mesures de traitement de l’infection gastro-intestinale comprennent:
- Réhydratation – orale et parfois intraveineuse
- Pour de nombreux cas de gastro-entérite bactérienne, seul un traitement symptomatique (fièvre, diarrhéefor) est nécessaire.
- Les antibiotiques ne sont généralement pas recommandés car ils n’ont aucun effet sur les infections virales, peuvent provoquer des effets secondaires et une utilisation excessive augmente le risque de développement de bactéries résistantes.
- Des antibiotiques peuvent être recommandés dans les cas particulièrement graves de gastro-entérite, ou si une bactérie spécifique a été identifiée comme la cause.
Lignes directrices
- Infectious Diseases Society of America (IDSA)
Lignes directrices pratiques pour la gestion de la diarrhée infectieuse. Maladies infectieuses cliniques 2001; 32:331-50
http://cid.oxfordjournals.org/content/32/3/331.fullMise à jour en cours pour 2014. - Organisation mondiale de Gastroentérologie
Guide de pratique: Diarrhée aiguë (LIEN:
http://www.worldgastroenterology.org/guidelines/global-guidelines/acute-diarrhea/acute-diarrhea-english
- Society for Healthcare Epidemiology of America (SHEA) / Infectious Diseases Society of America (IDSA)
Lignes directrices de pratique clinique pour l’infection à Clostridium difficile chez les adultes: Mise à jour 2010 par SHEA / IDSA Infect. Contrôle Hosp. Epidemiol. 2010; 31 (5): 000-000
http://www.jstor.org/stable/10.1086/651706
- Manuel des méthodes de détection et de caractérisation des rotavirus de l’Organisation mondiale de la santé
. 2009. IVB/08.17.
http://whqlibdoc.who.int/hq/2008/WHO_IVB_08.17_eng.pdf
- Centres de Contrôle et de Prévention des Maladies (CDC) du Département de la Santé et des Services sociaux des États-Unis
Lignes directrices pour le Contrôle des Infections environnementales dans les établissements de Santé
http://www.cdc.gov/hicpac/pdf/guidelines/eic_in_HCF_03.pdf
- Bryan CS. Maladies infectieuses en Soins primaires. Édition : Saunders. 2002
- Bibliothèque Médicale en ligne de Merck – Troubles gastro-intestinaux www.merck.com
- Bartlett JG. Pratique clinique. Diarrhée associée aux antibiotiques. N Engl J Med 2002; 346: 334-349
- Site web du CDC: http://www.cdc.gov/ecoli/
- Clin Microbiol Rev. 2006 Juillet; 19 (3): 449-490. doi: 10.1128/CMR.00054-05
« Pathogenèse de l’infection à Helicobacter pylori », Johannes G. Kusters, Arnoud H. M. van Vliet et Ernst J. Kuipers http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1539101/ - Site web du CDC: http://www.cdc.gov/rotavirus/index.html
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