AtlanteEdit
Nel 2002, due anni dopo il ritiro, Herrera è tornato ad allenare il suo ex club Atlante. Sarebbe rimasto manager per due anni, ma si è dimesso nel 2004 dopo non essere riuscito a prendere Atlante ad una finale.
MonterreyEdit
Per l’Apertura 2004, Herrera è stato nominato capo allenatore del Monterrey. Ha casualmente affrontato il suo ex club Atlante in semifinale, con Monterrey avanzando con un punteggio aggregato di 7-3. Alla fine non è riuscito a fare Monterrey champions, perdendo contro UNAM in finale con un punteggio aggregato di 3-1. Riuscì a portare Monterrey ad un’altra finale nel torneo Apertura 2005, ma fallì ancora una volta, questa volta perdendo contro Toluca con un punteggio aggregato di 6-3. Herrera avrebbe continuato ad essere manager del Monterrey fino al torneo Apertura 2007, dove il suo contratto è stato risolto nel settembre 2007 a causa della continua forma povera.
VeracruzEdit
Prima del Clausura 2008, Herrera è stato assunto come manager di Veracruz dopo le dimissioni di Antonio Mohamed. Una vittoria di rilievo per Herrera è stata una vittoria casalinga per 4-0 sul Club América il 29 marzo 2008. Fu incaricato di impedire al Veracruz di essere retrocesso in Primera División A, anche se il Veracruz fu inevitabilmente retrocesso. Herrera si separò dal club nel maggio 2008.
Estudiantes TecosEdit
Poco dopo aver lasciato Veracruz, Herrera è stato assunto per gestire un Estudiantes Tecos in difficoltà a metà del torneo Apertura 2008 per sostituire José Luis Trejo. È stato licenziato il 6 settembre 2010 dopo che Tecos ha subito una sconfitta per 0-3 contro il Guadalajara durante una partita di campionato del torneo Apertura.
Ritorno all’AtlanteEdit
Nel novembre 2010 è stato annunciato che Herrera è stato assunto come nuovo allenatore dell’Atlante, tornando al suo ex club dopo il suo primo periodo manageriale nel 2002. Sotto il suo regno, Atlante è arrivato quarto nel Clausura 2011, anche se sarebbe stato eliminato ai quarti di finale dal Cruz Azul. Atlante non è riuscito a qualificarsi per i playoff dell’Apertura 2011, e Herrera non ha rinnovato il suo contratto con il club. Ci sono stati rapporti che lo collegano con il Club América come nuovo manager per la stagione successiva.
AméricaEdit
Il 16 novembre 2011, Herrera è stato ufficialmente nominato manager del Club América. Nella sua prima conferenza stampa, Herrera ha rivelato di aver firmato un contratto di sei mesi, dicendo: “f in sei mesi non do risultati, me ne andrò. Il 7 gennaio 2012, l’América sconfisse il Quéretaro per 2-0, che fu la prima vittoria ufficiale di Herrera con l’América. L’América concluse il Clausura al terzo posto e raggiunse le semifinali, venendo eliminata dal Monterrey con un punteggio aggregato di 0-2. Il 14 maggio, Miguel Herrera è stato ratificato come manager. Ha portato il club ad un quarto posto finale la seguente Apertura, ancora una volta essere eliminato in semifinale a seguito di una perdita aggregata 2-3 a Toluca.
Il 26 maggio 2013, l’América ha vinto l’undicesimo titolo della sua storia sconfiggendo il Cruz Azul 4-2 ai rigori dopo una drammatica rimonta da 0-1 all’andata per pareggiare 2-2 in totale, e giocando la gara di ritorno con dieci uomini per oltre 105 minuti. E ‘ stato il primo titolo di Herrera nella sua carriera manageriale dopo aver perso le sue due finali precedenti, mentre a Monterrey.
La seguente Apertura, Herrera ha portato l’América ad un’altra finale di campionato dopo aver superato la classifica con 37 punti, tuttavia sono stati sconfitti dal León. A metà del torneo, Herrera è stato nominato allenatore ad interim della squadra nazionale del Messico; il suo assistente Ávaro Galindo ha allenato l’América fino al ritorno di Herrera a novembre. In seguito è stato annunciato che Herrera avrebbe assunto come capo allenatore della squadra messicana su base permanente.
Squadra nazionale del messicomodifica
Il 18 ottobre 2013, Herrera è stato nominato allenatore ad interim del Messico, sostituendo Víctor Manuel Vucetich per diventare il quarto allenatore della nazionale nel giro di un mese. Ha guidato El Tri ad una vittoria aggregata 9-3 sulla Nuova Zelanda nel play-off inter-confederazione per qualificarsi per la Coppa del Mondo 2014 in Brasile. Il 2 dicembre, è stato annunciato che Herrera sarebbe rimasto allenatore della nazionale almeno per tutta la Coppa del Mondo.
Alla Coppa del Mondo, il Messico è arrivato secondo nel proprio gruppo con 7 punti, ottenendo vittorie contro Camerun e Croazia e assicurandosi un pareggio senza reti contro la nazione ospitante.Hanno affrontato i Paesi Bassi nel round-of-16, dove il Messico è stato polemicamente eliminato dopo aver ceduto a una sconfitta 2-1. Il 3 dicembre, ha dichiarato che il suo contratto con la nazionale è stato rinnovato.
Il Messico non è riuscito a superare la fase a gironi della Copa América 2015, ottenendo solo due pareggi e una sconfitta. Il 26 luglio 2015, il Messico ha vinto la CONCACAF Gold Cup dopo aver sconfitto la Giamaica 3-1 in finale. Due giorni dopo, Herrera è stato rilasciato come allenatore della squadra nazionale del Messico dopo un presunto alterco fisico con TV Azteca annunciatore Christian Martinoli – che era stato critico di Herrera – mentre i due aspettavano in linea TSA presso l’aeroporto internazionale di Philadelphia.
TijuanaEdit
Il 2 novembre 2015, Herrera è stato nominato manager di Tijuana. Ha gestito il club fino a maggio 2017, qualificandosi per i play-off due volte.
Ritorno all’AméricaEdit
Il 26 maggio 2017, il nuovo presidente dello sporting Santiago Baños ha annunciato ufficialmente il ritorno di Herrera al Club América. Ha perso nella sua prima partita ufficiale come manager del club, una sconfitta per 1-2 contro il Querétaro nella Supercopa MX. Sei giorni dopo, l’América perse nuovamente contro il Querétaro, questa volta con un punteggio di 0-1, nella partita di apertura del torneo. La settimana seguente, Herrera ha vinto la sua prima partita di campionato nel suo secondo periodo con l’América, sconfiggendo il Pachuca 2-0 all’Estadio Hidalgo. Herrera ha portato l’América al terzo posto durante la fase regolare dell’Apertura, tuttavia sono stati eliminati in semifinale dal Tigres UANL. L’América è anche uscito dalla CONCACAF Champions League 2018 a Toronto FC in semifinale. Il club ha terminato il seguente torneo di Clausura al secondo posto, ed è stato nuovamente eliminato nella fase semifinale, questa volta perdendo contro Santos Laguna con un punteggio aggregato di 6-3.
Herrera ha portato l’América ad un altro secondo posto nell’Apertura 2018, subendo solo due sconfitte durante la fase regolare del torneo, ed è rimasto imbattuto nei playoff. Il 16 dicembre, Herrera ha vinto il suo secondo campionato – entrambi con il Club América-dopo una vittoria aggregata 2-0 sul Cruz Azul in finale. Ha anche guidato la squadra su una striscia di imbattibilità di 17 partite in rotta verso la vittoria del campionato, eguagliando il record stabilito dal club sotto Mario Carrillo nel 2005 quando vinse il Clausura di quell’anno.
Il 5 febbraio 2019, Herrera ha raggiunto 100 vittorie in carica del Club América dopo una vittoria per 3-1 sul Necaxa in Copa MX, diventando il terzo allenatore nella storia del club dopo Jose Antonio Roca e Carlos Reinoso a raggiungere quel traguardo. L ‘ 11 aprile, l’América sconfisse l’FC Juárez per 1-0 nella finale di Clausura della Copa MX. Questo è stato il primo titolo di Herrera nella sua carriera, e il suo terzo titolo assoluto con il Club América.
Il 21 dicembre 2020, due giorni dopo essere stato eliminato dal Los Angeles FC dalla CONCACAF Champions League, dove è stato coinvolto in una rissa nel primo tempo, Herrera è stato licenziato dall’América.