Der deutsche Sexualwissenschaftler Volkmar Sigusch verwendete in einer Peer-Review-Publikation den Neologismus cissexuell. In seinem 1998 erschienenen Essay „The Neosexual Revolution“ zitiert er seinen zweiteiligen Artikel „Die Transsexuellen und unser nosomorpher Blick“ von 1991 als Ursprung des Begriffs.
Cisgender hat seinen Ursprung im lateinischen Präfix cis-, was „auf dieser Seite von“ bedeutet, was das Gegenteil von trans- bedeutet, was „gegenüber“ oder „auf der anderen Seite von“ bedeutet. Diese Verwendung kann in der Cis–Trans–Unterscheidung in der Chemie, den Cis- und Trans-Seiten des Golgi-Apparats in der Zellbiologie, dem Cis-Trans- oder Komplementationstest in der Genetik, in Ciscaucasia (aus russischer Perspektive), im alten römischen Begriff Cisalpine Gallien (d. H. „Gallien auf dieser Seite der Alpen“), Ciskei und Transkei (getrennt durch den Kei-Fluss) und in jüngerer Zeit Cisjordan, im Unterschied zu Transjordan. Im Falle des Geschlechts, cis- beschreibt die Angleichung der Geschlechtsidentität an das zugewiesene Geschlecht.Die Soziologen Kristen Schilt und Laurel Westbrook definieren Cisgender als Bezeichnung für „Personen, die eine Übereinstimmung zwischen dem Geschlecht, das ihnen bei der Geburt zugewiesen wurde, ihrem Körper und ihrer persönlichen Identität haben“. Eine Reihe von Ableitungen der Begriffe cisgender und cissexual umfassen cis männlich für „männlich zugewiesen männlich bei der Geburt“, cis weiblich für „weiblich zugewiesen weiblich bei der Geburt“, analog cis Mann und cis Frau, und cissexism und cissexual Annahme. Darüber hinaus verwendete eine im Journal der International AIDS Society veröffentlichte Studie den Begriff Cisnormativität, ähnlich der Heteronormativität von Sexual Diversity Studies. Ein verwandtes Adjektiv ist gender-normativ, weil, wie Eli R. Green schreibt, „‚cisgendered‘ verwendet wird, um sich auf Menschen zu beziehen, die sich nicht mit einer geschlechtsspezifischen Erfahrung identifizieren, ohne die Existenz eines normativen Geschlechtsausdrucks durchzusetzen“. Auf diese Weise ist Cisgender vorzuziehen, da es im Gegensatz zum Begriff geschlechtsnormativ nicht impliziert, dass Transgender-Identitäten abnormal sind.Julia Serano hat cissexual als „Menschen definiert, die nicht transsexuell sind und die immer nur ihr geistiges und physisches Geschlecht als ausgerichtet erlebt haben“, während Cisgender ein etwas engerer Begriff für diejenigen ist, die sich nicht als Transgender identifizieren (eine größere kulturelle Kategorie als die klinischere Transsexuelle). Für Jessica Cadwallader ist Cissexual „eine Möglichkeit, auf die nicht gekennzeichnete Norm aufmerksam zu machen, gegen die Trans identifiziert wird, in der eine Person das Gefühl hat, dass ihre Geschlechtsidentität zu ihrem Körper / Geschlecht passt“.Die Begriffe Cisgender und cissexual wurden 2006 in einem Artikel im Journal of Lesbian Studies und in Seranos 2007 erschienenem Buch Whipping Girl verwendet, woraufhin der Begriff unter englischsprachigen Aktivisten und Wissenschaftlern an Popularität gewann. Jillana Enteen schrieb 2009, dass cissexual „zeigen soll, dass es eingebettete Annahmen gibt, die diese nahtlose Konformität erwarten“.Serano verwendet auch den verwandten Begriff Cissexismus, „der die Überzeugung ist, dass die identifizierten Geschlechter von Transsexuellen denen von Cissexuellen unterlegen oder weniger authentisch sind“. Im Jahr 2010 erschien der Begriff Cisgender Privileg in der akademischen Literatur, definiert als die „Reihe von unverdienten Vorteilen, die Personen, die sich als das Geschlecht identifizieren, das ihnen bei der Geburt zugewiesen wurde, ausschließlich aufgrund einer Cisgender-Identität“.Während einige glauben, dass der Begriff Cisgender nur politisch korrekt ist, verwenden medizinische Akademiker den Begriff und haben seine Bedeutung in Transgender-Studien seit den 1990er Jahren erkannt.Im Februar 2014 begann Facebook, „benutzerdefinierte“ Geschlechtsoptionen anzubieten, mit denen sich Benutzer mit einem oder mehreren geschlechtsbezogenen Begriffen aus einer ausgewählten Liste identifizieren können, darunter cis, cisgender und andere. Cisgender wurde 2013 auch in das Oxford English Dictionary aufgenommen und definiert als „Bezeichnung einer Person, deren Sinn für persönliche Identität dem Geschlecht und Geschlecht entspricht, das ihr bei der Geburt zugewiesen wurde (im Gegensatz zu Transgender)“. Perspektiven auf die Geschichte haben das seit dieser Aufnahme festgestellt, Der Begriff Cisgender wird zunehmend gebräuchlich.