エンドソームと接続する経路を持つ3つの主要なコンパートメントがあります。 より多くの経路は、メラノサイトおよび偏光細胞のような特殊化された細胞に存在する。 例えば、上皮細胞では、transcytosisと呼ばれる特別なプロセスは、いくつかの材料が細胞の一方の側に入り、反対側から出ることを可能にする。 また、いくつかの状況では、後期エンドソーム/Mvbは、リソソームではなく原形質膜と融合し、現在エキソソームと呼ばれる内腔小胞を細胞外培地に放出する。
これらの経路の正確な性質についてのコンセンサスはなく、任意の状況で任意の貨物が取る順次経路は議論の問題になる傾向があります。
ゴルジ体からエンドソームへ
小胞はゴルジ体とエンドソームの間を両方向に通過する。 GGAsおよびAP-1クラスリン被覆小胞アダプターは、エンドソームに分子を運ぶゴルジで小胞を作る。 逆の方向では、レトロマーはゴルジに戻って分子を運ぶ初期のエンドソームで小胞を生成します。 いくつかの研究では、Rab9とTIP47によって媒介される後期エンドソームからゴルジへの逆行性の交通経路を記述するが、他の研究ではこれらの知見に異議を唱えている。 これらの経路に従う分子には、エンドサイトーシス経路にリソソーム加水分解酵素を運ぶマンノース-6-リン酸受容体が含まれる。 加水分解酵素はエンドソームの酸性環境で放出され、受容体はレトロマーとRab9によってゴルジに回収される。
原形質膜から初期エンドソームへ（エンドソームのリサイクルを介して）Edit
分子は、原形質膜からエンドサイトーシス小胞の初期エンドソームに送達される。 分子は、クラスリン被覆小胞における受容体媒介エンドサイトーシスを介して内在化することができる。 他のタイプの小胞はまた、カベオリンを利用するものを含む、この経路のための原形質膜で形成される。 小胞はまた、分子を直接原形質膜に輸送するが、多くの分子は、最初にリサイクルエンドソームと融合する小胞内で輸送される。 このリサイクル経路に続く分子は、初期エンドソームの細管に集中している。 これらの経路に従う分子には、LDL、上皮成長因子（EGF）、および鉄輸送タンパク質トランスフェリンの受容体が含まれる。 原形質膜からのこれらの受容体の内在化は、受容体媒介性エンドサイトーシスによって起こる。 LDLは、より低いpHのためにエンドソームで放出され、受容体は細胞表面にリサイクルされる。 コレステロールは主に（LDL）によって血液中に運ばれ、LDL受容体による輸送は、コレステロールが細胞によって取り込まれる主なメカニズムである。 ＥＧＦは、ｅｇｆが結合するときに活性化される。 活性化された受容体は、リソソームにおけるそれら自身の内在化および分解を刺激する。 EGFは、エンドソームにエンドサイトーシスされると、EGF受容体（EGFR）に結合したままである。 活性化されたEgfrは、それら自身のユビキチン化を刺激し、これはそれらを内腔小胞（下記参照）に誘導するので、それらは原形質膜に再循環されない。 これは、細胞質ゾルからタンパク質のシグナル伝達部分を除去し、したがって、成長の継続的な刺激を防止する-EGFで刺激されていない細胞では、Egfrは トランスフェリンもその受容体と関連しているが、酸性エンドソームではトランスフェリンから鉄が放出され、鉄を含まないトランスフェリン（トランスフェリン受容体に結合している）が初期エンドソームから細胞表面に直接およびリサイクルエンドソームを介して戻る。
Late endosomes to lysosomesEdit
late endosomesからlysosomesへの輸送は、late endosomesがlysosomesと融合する過程で”消費”されるため、本質的には単方向性です。 したがって、エンドソームの内腔内の可溶性分子は、何らかの方法で回収されない限り、リソソームに終わる傾向がある。 膜貫通タンパク質は、リソソームの周囲膜または内腔に送達することができる。 リソソーム内腔に向かう膜貫通タンパク質は、周囲膜からエンドソームに芽を出す小胞に分類され、初期のエンドソームで始まるプロセスである。 エンドソームが後期エンドソーム/MVBに成熟し、リソソームと融合すると、内腔内の小胞がリソソーム内腔に送達される。 蛋白質はユビキチンの付加によってこの細道のために印が付いています。 輸送（ESCRTs）に必要なエンドソームソート複合体は、このユビキチンを認識し、形成内腔小胞にタンパク質をソートします。 これらの経路に従う分子には、LDLおよびマンノース-6-リン酸受容体によって送達されるリソソーム加水分解酵素が含まれる。 これらの可溶性分子はエンドソームに残り、したがってリソソームに送達される。 また、EGFに結合した膜貫通Egfrはユビキチンでタグ付けされているため、ESCRTsによって内腔小胞に分類されます。