De acuerdo con las doctrinas del Catolicismo Romano, la Ortodoxia Oriental, la Ortodoxia Oriental y la mayoría de las formas de protestantismo, como el Luteranismo y el Anglicanismo, un bautismo no es válido a menos que se use la fórmula trinitaria en la administración de ese sacramento. En consecuencia, es posible que no reconozcan a las comunidades religiosas que bautizan sin esta fórmula – por ejemplo, Unitarios, Branhamistas, Francos, Testigos de Jehová y Pentecostales Unificados, todos los cuales niegan la Trinidad – como religiones cristianas. Este es también el caso de los bautismos dentro de la Iglesia de Jesucristo de los Santos de los Últimos Días (iglesia SUD). Aunque los miembros SUD bautizan con la misma fórmula trinitaria, rechazan la concepción trinitaria nicea y consideran a las tres personas de la Trinidad como personajes distintos unidos no en sustancia, sino en dominio y propósito.
Los conversos a denominaciones trinitarias del mormonismo y otras denominaciones no trinitarias tienen que ser bautizados en el nombre de la Trinidad (Nicea). Otras religiones (Francos, Pentecostales Unicistas y Branhamistas en particular) usan la fórmula «En el nombre de Jesucristo» (basada en Hechos 2:38) para el bautismo, y a su vez re-bautizan a los conversos que fueron bautizados por primera vez bajo la fórmula trinitaria, a veces afirmando que tales personas no habrían sido conscientes previamente de que «Jesús es el Señor».
El bautismo según la fórmula trinitaria es visto como una base para el ecumenismo cristiano, el concepto de unidad entre cristianos pertenecientes a diferentes denominaciones cristianas.