als onderdeel van uw onderzoek, Las u een artikel dat BALB/c muizen vermeldt. Je spoort die muis op in de Jax® Muizen Database, en je vraagt je af welke balb/C muis de onderzoekers gebruikten – BALB/cJ (000651) of BALB/cByJ (001026). Wat is het verschil (indien aanwezig), en welke moet u gebruiken voor uw onderzoek?
Substrains: wat bedoel je met ze zijn niet allemaal hetzelfde?
laten we beginnen met het beantwoorden van deze vraag door kort te bekijken wat substrains zijn. Een substrine kan op een aantal manieren ontstaan: 1) wanneer een spontane mutatie in een kolonie wordt gefixeerd, en die kolonie als een aparte lijn wordt gehandhaafd, 2) wanneer muizen van dezelfde ouderkolonie gedurende 20 generaties of meer apart worden gehouden. Laten we ons concentreren op de tweede manier. Stel dat jij en ik BALB/c muizen van dezelfde bron hebben. Als mijn kolonie al 11 generaties broedt, en de jouwe al negen generaties, dan zijn onze twee kolonies technisch gezien ondergrens van elkaar. Waarom? Omdat ze 20 generaties (11 + 9) uit elkaar liggen, en gedurende die tijd kunnen spontane mutaties ontstaan die resulteren in unieke fenotypische verschillen.op dezelfde manier scheidde de oorspronkelijke balb/C stam in 1935 in twee belangrijke substrainen (BALB/CJ en balb/cByJ). Meer details over de historische ontwikkeling van deze twee substrains zijn te vinden in Potter et al. 1985 (geschiedenis van de BALB / c familie, Curr onderwerpen Microbiol Immunol. 122: 1-5), the mouse Genome Informatics website, the Origins of inteelt Mice, and in the Handbook on Genetically Standardized Jax Mice. Hoewel ze nauw verwant zijn, zijn BALB/CJ en balb/cByJ niet identiek.
genetische verschillen maken het verschil
bekende genetische verschillen tussen deze twee substrainen omvatten ten minste drie mutaties in de balb / cByJ stam: 1) Acadsdel-J (acyl-Coenzyme A dehydrogenase, korte keten) en 2) Ahrb-2 (aryl-koolwaterstof receptor). Hoewel deze twee stammen worden beschouwd als afgestemd op de belangrijkste histocompatibiliteit Complex (MHC) (ze hebben het H2D haplotype) en weefsels kunnen worden getransplanteerd tussen stammen, de klasse 1b locus in BALB/cByJ bevat een deletie inQa-2 op chromosoom 17 (Mellor, A., et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA 82: 5920, 1985). Voor extra variaties tussen BALB / c substrains die over de hele wereld worden onderhouden, zie de BALB/C muis. Genetics and Immunology, M. Potter (ed.), Actuele onderwerpen in een Microbiologie en Immunologie 122, Springer-Verlag, 1985.
fenotypische verschillen: je bent niet de stam die ik eerder kende!
zoals je zou verwachten van twee soorten die sinds 1935 apart broeden, hebben BALB/cJ en balb/cByJ talrijke fenotypische verschillen. BALB/cByJ heeft een hogere voortplantingsprestatie en is minder agressief dan BALB / CJ. BALB / cByJ vrouwtjes zijn goede moeders en worden vaak gebruikt als pleegmoeders. BALB / cByJ muizen hebben spontane dystrofische cardiale calcinose, verhoogde vrije vetzuren, hoge triglyceride niveaus, en een aantal hematologische afwijkingen. Andere fenotypes tussen deze stammen worden vergeleken in de database van het Muizenfenoom.
selectie van substrains: en de winnaar is…
nu je weet dat substrains van BALB/c bestaan, is het tijd om te beslissen. Uiteindelijk hangt de keuze welke BALB/c-stof het meest geschikt is voor uw onderzoek af van een aantal factoren. Als u probeert te herhalen of voort te bouwen op eerdere experimenten, maak er dan alles aan om dezelfde stam te identificeren en te gebruiken. Op die manier vermijd je verschillen in genetische achtergrond en fenotype. Het toevoegen van een nieuwe variabele aan uw experimentele ontwerp is het laatste wat je wilt doen. Het is al moeilijk genoeg om statistisch significante resultaten te krijgen! Als u een nieuwe onderzoekslijn begint, overweeg dan het gedrag, de fokprestaties en gedocumenteerde genetische en fenotypische kenmerken van de twee substrains.