TEKST
Gram-negative baciller (GNB) er assosiert med blodbaneinfeksjoner (BSI) som resulterer i signifikant dødelighet, spesielt hos pasienter i intensivavdelinger (Icu). BLANT DE mest utbredte GNB-patogenene er Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae og Pseudomonas aeruginosa (4, 8). Utvalget av empirisk terapi for GNB-infeksjoner er utfordrende på grunn av iboende antimikrobiell resistens blant mange P. aeruginosa stammer og fremvoksende resistens mot karbapenem antimikrobielle midler blant k. pneumoniae isolater. Rask samme dag patogenidentifikasjon (ID) direkte fra nylig positive blodkulturflasker kan påvirke riktig utvalg av empirisk terapi, en viktig faktor for å forbedre pasientens utfall (7). Peptid nukleinsyre fluorescens in situ hybridisering (Pna FISK) analyser (AdvanDx Inc.) har vist seg å sammenligne gunstig med automatiserte fenotypiske ID-metoder og kan gi resultater i omtrent 90 min (10). En begrensning av dagens FDA-ryddet GNB PNA FISH assays (E. coli / p. aeruginosa PNA FISK Og E. coli, k. pneumoniae / P. aeruginosa PNA FISK) er manglende evne til å skille E. coli Fra K. pneumoniae. Denne multisenterstudien evaluerte ytelsen TIL GNR (Gram-negativ stang) TRAFIKKLYS PNA FISK (IKKE FDA ryddet på tidspunktet for denne studien), den første raske PNA FISKEANALYSEN for å identifisere 3 store GNB (E. coli, K. pneumoniae og p. aeruginosa) direkte fra nylig positive blodkulturer.Fire AMERIKANSKE studiesteder samlet GNB-positive kliniske blodkulturer. Den fenotypiske ID-metoden for hvert laboratorium ble utført ved Bruk Av Enten MicroScan (Siemens Healthcare Diagnostics, Tarrytown, NY) eller VITEK2 (biom@rieux, Inc., Durham, NC). Data samlet inn for denne studien hadde ingen pasientidentifikatorer, og bare blodkulturer ble trukket for kliniske formål ble brukt. Institutional Review Board (IRB) godkjenning eller unntak ble innhentet for studieprotokollen fra hver institusjon. Hvert nettsted brukte ett av de følgende tre automatiserte, kontinuerlig overvåkende blodkultursystemene: BacT/Alert (biom@rieux, Inc., Durham, NC), BACTEC (Bd Diagnostikk, Spark, MD), Eller VersaTrek (Trek Diagnostiske Systemer, Cleveland, OH). FOR hver prøve BLE GNR Trafikklys PNA FISK utført, i henhold til produsentens instruksjoner. Lysbilder ble undersøkt med fluorescensmikroskopi (60× eller 100× oljemål, dual-bandpass fluoresceinisotiocyanat/Texas Red filter). Resultatene ble tolket som positive når fluorescerende celler ble sett i flere synsfelt, som følger: grønn For E. coli, rød For P. aeruginosa og gul for K. pneumoniae. I TILLEGG, EK / P. aeruginosa PNA FISK ble utført på hver prøve(data ikke vist). GNR Lyskryss PNA FISK ble utført samtidig med rutinemessig laboratorium ID på overflødig blodkultur materiale. Operatøren av PNA-FISKETESTING på hvert studiested ble blindet for resultatene av rutinemessig laboratorie-ID til all testing var fullført.
totalt 490 kliniske blodkulturer som var positive for GNB Ved Gramfarging, og 4 blodkulturflasker med kliniske p. aeruginosa-isolater ble inkludert i studien. Automatiserte fenotypiske ID-metoder identifiserte 537 isolater, inkludert 43 i blandede vekstkulturer av 2 eller flere organismer. Av de identifiserte organismene var 186 (34,6%) E. coli, 110 (20,5%) K. pneumoniae og 48 (8,9%) p. aeruginosa. Av de 43 blandede kulturer, 15 ble identifisert som å ha 2 AV GNR Trafikklys PNA FISK målorganismer til stede, og ble derfor forventet å vise 2 fluorescens resultater. GNR Trafikklys PNA FISK korrekt identifisert 100% (186/186) Av E. coli isolater, 99,1% (109/110) Av K. pneumoniae isolater, og 95,8% (46/48) Av P. aeruginosa isolater (Tabell 1). En falsk negativ For k. pneumoniae og to falske negativer For p. aeruginosa, alle i blandede kulturer, ble registrert (isolater var ikke tilgjengelige for retesting). Ifølge produsentens merking av de andre PNA-fiskeanalysene, Som E. coli/p. aeruginosa PNA-FISK, er deteksjonsgrensen (LOD) 105 CFU. I blandede kulturer er det mulig at en organisme kan vokse den andre og at flasken kan signalisere positivt på den automatiserte blodkulturenheten før begge organismer når DENNE LOD for PNA-fiskeanalysen. Specificiteten av testen var 98.2% (162/165). Blandede kulturer som inneholdt mer enn ett isolat enn E. coli, p. aeruginosa eller K. pneumoniae (28 i alt) ble talt en gang i spesifisitetsberegningene, siden bare ett negativt resultat kunne forventes å bli observert om gangen. En Enterobacter cloacae-prøve ga et falskt positivt E. coli (grønt) – resultat (negativt ved gjentatt testing), og En Acinetobacter baumannii-prøve ga et falskt positivt P. aeruginosa (rødt) – resultat (isolat/prøve utilgjengelig for ytterligere testing). En annen falsk positiv P. aeruginosa (rødt) – resultat oppstod med en prøve som inneholdt Acinetobacter radioresistens, et sjeldent klinisk isolat. Analyse av offentlig tilgjengelige sekvenser (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) viste en delvis komplementær sekvenslikhet For a. radioresistens med p. aeruginosa pna-sonden.
- Vis inline
- vis popup
ytelsesegenskaper VED GNR Traffic Light PNA FISH assayg
Upassende innledende antibiotikavalg og forsinkelser i oppstart av effektiv antimikrobiell behandling har vist seg å påvirke dødeligheten negativt hos pasienter MED GNB BSI (6, 7, 9) og For Pseudomonas BSI har det vært forbundet med lengre sykehusopphold (9). Rask identifisering Av E. coli, p. aeruginosa eller K. pneumoniae fra blodkulturflasker har potensial til å påvirke kliniske beslutninger ved å tillate et tidlig valg av effektiv målrettet antimikrobiell terapi og dermed bedre pasientutfall og reduserte lengder av sykehusopphold. Når arten er identifisert, kan et terapeutisk regime med antipseudomonal aktivitet som tobramycin eller piperacillin-tazobactam velges for p. aeruginosa-infeksjon og ceftriaxon eller andre egnede legemidler mot e. coli-bakteriemi. Tidlig identifisering Av K. pneumoniae i blodkulturen vil muliggjøre rask initiering av egnet behandling basert på resistensmønsteret til denne organismen i en gitt institusjon, som for eksempel transport av utvidet spektrum β-laktamase (ESBL) eller prevalens av karbapenemresistens. Rapid PNA FISH-resultater negative For E. coli, p. aeruginosa eller K. pneumoniae har vist seg å indikere en økning i sannsynligheten for at et isolat er resistent mot et cefalosporin, noe som ytterligere støtter konseptet med rask patogen ID som påvirker terapeutiske beslutninger (5).denne studien viste AT GNR Trafikklys PNA FISK er en svært følsom og spesifikk analyse for å identifisere den vanligste GNB gjenvunnet fra nylig positive blodkulturflasker. Tid til resultater FOR GNR Trafikklys PNA FISK fra en positiv blodkultur er ca 90 min (hands-on teknolog tid er ca 10 min per test), sammenlignet med 1 til 3 dager for konvensjonelle fenotypiske metoder. Mens vurderingen av DEN faktiske kostnaden FOR GNR Traffic Light pna FISH-implementeringen var utenfor omfanget av denne studien, er den omtrentlige kostnaden per test basert på produsentens listepris $39 (ikke inkludert kontroller), Med En Medicare-refusjon på $84,66. Som foreslått av studier av ANDRE PNA-fiskeanalyser, vil laboratoriekostnader for implementering AV GNR-TRAFIKKLYS PNA-FISK være forsvarlig målt mot forbedrede pasientutfall, reduserte lengder på sykehusopphold og fornuftig bruk av antimikrobiell behandling (1, 2, 3). DEN direkte effekten AV GNR Trafikklys PNA FISK på valg av passende empirisk terapi, påfølgende pasientutfall, og kostnadsfordeler vil være områder av interesse for fremtidige studier.