双子研究

双子のデザインのパワーは、双子が一卵性双生児(同一(MZ):単一の受精卵から発達し、したがってすべての対立遺伝子を共有する)または二卵性(DZ:二つの受精卵から発達し、したがってそれらの多形対立遺伝子の平均50%を共有する、非双子の兄弟に見られるような遺伝的類似性の同じレベル)のいずれかである可能性があるという事実から生じる。 これらの既知の遺伝的類似性の違いは、同一の双子と兄弟の双子の等しい環境の検証可能な仮定とともに、表現型に対する遺伝的および環境的分散の効果を探索するための双子の設計の基礎を作り出します。

双子研究の基本的な論理は、分散の概念とそこから派生した相関の理解を超えて、ほとんど数学で理解することができます。

Classical twin method edit

すべての行動遺伝学的研究と同様に、古典的な双子の研究は、大規模なグループ内の行動(遺伝学者によって表現型と呼ばれる)の分散を評価することから始まり、これのどれだけが原因であるかを推定しようとする。

  • 遺伝的影響(遺伝性);
  • 共有環境–両方の双子に起こるイベント、同じ方法でそれらに影響を与える。
  • 共有されていない、またはユニークな、または非共有環境–一方の双子には発生しますが、他方の双子には発生しないイベント、またはいずれかの双子に別の方法で影響を与えるイベント。

通常、これらの3つのコンポーネントは、a(加法遺伝学)C(共通環境)およびE(固有環境)と呼ばれます。 非加法的遺伝学的効果を調べることも可能である(多くの場合、優位性(ADEモデル)のためにDと示される;より複雑な双子の設計については以下を参照)。ACEモデルは、共有環境または非共有環境による割合に対して、形質内の分散の割合が遺伝可能であることを示します。

ACEモデルは、共有環境または非共有環境による割合に対して、形質内の分散の割合が遺伝可能であることを示します。 研究はOpenMxなどのSEMプログラムを使用して行われますが、ツインデザインのコアロジックは以下のように同じです:家族で育てられた一卵性双生児(同一–MZ)双子は、遺伝子の100%と共有環境のすべてを共有しています。

家族で育てられた一卵性双生児は、遺伝子の100%と共 これらの状況でそれらの間に生じる違いは、ランダム(一意)です。 一卵性双生児間の相関はA+Cの推定値を提供します。二卵性双生児(DZ)双子もCを共有しますが、その遺伝子の平均50%を共有しています:兄弟双生児間の相関はΒ A+Cの直接推定値です。rが相関であれば、rmzとrdzは単に同一の双子と兄弟双生児の形質の相関です。 任意の特定の特性については、:したがって、rmz=A+C rdz=Σ A+C

aは、同一の双子相関と兄弟姉妹の双子相関の差の2倍です:相加的遺伝的効果(ファルコナーの公式)。 ランダムな(一意の)因子Eは1−rmzであり、すなわち、MZ双生児は一意の環境のみによって異なる。 (Jinks&Fulker,1970;Plomin,DeFries,McClearn,&McGuffin,2001)。

再び述べたように、これら二つの合計の差は、その後、私たちはA、C、およびEを解くことができます。 同一の相関と兄弟の相関の違いは、遺伝的類似性の半減によるものであるため、相加的遺伝的効果’A’は、同一の相関と兄弟の相関の違いの二倍にすぎません。

a=2(rmz−rdz)

同一の相関がAとCの完全な効果を反映しているため、Eはこの相関を1から減算することによって推定することができます

E=1−rmz

最後に、Cを導出することができます。:

C=rmz−A

Modern modelingEdit

1970年代から、研究は最尤法を用いた遺伝的、環境的影響のモデル化に移行しました(Martin&Eaves、1977)。 計算上ははるかに複雑ですが、このアプローチには多くの利点があり、現在の研究ではほぼ普遍的です。

(デンマークの男性の間で高さの遺伝性のための)例の構造モデルが示されています:

左のモデルAは、高さの生の分散を示しています。 これは、遺伝子や環境の絶対的な影響を保存し、これらを高さの変化のmmなどの自然な単位で表現するので有用である。 場合によっては、パラメータを標準化すると便利なので、それぞれは総分散の割合として表されます。 分散をa、C、およびEに分解したので、総分散は単純にA+C+Eです。 遺伝性は、標準化された遺伝的効果である。

Model comparisonEdit

モデリングの主な利点は、モデルを明示的に比較できることです。 したがって、例えば、行動に対する家族または共有環境の予測された効果をテストするために、A Eモデルを完全なACEモデルと客観的に比較することがで たとえば、上の図の高さを尋ねることができます:c(共有環境)は、フィット感を大幅に失うことなく落とすことができますか? あるいは、各パスについて信頼区間を計算することもできます。

マルチグループおよび多変量モデリング編集

多変量モデリングは、独立しているように見える変数間の遺伝的関係についての質問に答 例えば:IQと長期記憶は遺伝子を共有していますか? 彼らは環境の原因を共有していますか? その他の利点には、間隔、しきい値、および連続データを処理する機能、欠損値を持つデータからの完全な情報を保持する機能、潜在的なモデリングを測定された変数と統合する機能、環境を測定する機能、またはSnpなどの分子遺伝マーカーを測定する機能などがあります。 さらに、モデルは粗相関法における制約の問題を回避します。

測定された環境と潜在的な因果行動の繰り返し測定を用いた多変量および複数時間波研究が現在標準である。 これらのモデルの例には、拡張ツインデザイン、シンプレックスモデル、および成長曲線モデルが含まれます。

OpenMxや制約や複数のグループに適した他のアプリケーションなどのSEMプログラムは、合理的に熟練したユーザーが新しい技術を利用できるようにしました。

環境のモデリング: MZ discordant designsEdit

MZ双子は遺伝子と家族レベルの環境要因の両方を共有しているため、MZ双子の違いはE:ユニークな環境を反映しています。 研究者は、この情報を使用して環境を強力な方法で理解することができ、遺伝子-環境共分散、逆因果関係、交絡などの要因によって一般的に交絡する因果関係の疫学的テストを可能にします。

正のMZ不協和音効果の例を左に示します。 特性1で高いスコアを獲得した双子は、特性2でも高いスコアを獲得します。 これは、形質1の「用量」と互換性があり、形質2の増加を引き起こす。 もちろん、特性2も特性1に影響を与える可能性があります。 これらの2つの可能性を分離するには、異なる設計が必要です(例については以下を参照)。 Nullの結果は、因果仮説と互換性がありません。P>

A: 生の(非標準化された)分散係数を示すエースモデル

B:標準化された分散係数を示すエースモデル

B:標準化された分散係数を示すエースモデル

運動がうつ病から保護する仮説のmz不一致テスト

例えば、うつ病と運動の間の観察されたリンクの場合を取る(右上の図を参照)。 落ち込んでいる人も少し身体活動をして報告しています。 これは因果関係であると仮定するかもしれません:運動をしている患者に「投薬する」ことは気分を高め、うつ病から保護するでしょう。 次の図は、この仮説の経験的検定が発見したものを示しています。

縦不和デザイン

クロスラグ縦MZ不和ツインデザイン。 このモデルは、時間1での形質間の違いの間の関係を考慮し、trait1の増分が将来的にその形質のその後の変化を駆動する、または重要なことに、他の形質次の図に見られるように、この設計は複数の測定値に拡張することができ、結果として学習できる情報の種類が増加します。 これは、クロスラグドモデル(複数の特性が複数の時間にわたって測定される)と呼ばれます。

縦不和モデルでは、一卵性双生児間の違いを使用して、時間1(パスA)における形質間の違いの関係を考慮し、trait1の増分が将来のその形質(パスBとE)、また重要なことに他の形質(パスC&D)におけるその後の変化を駆動するという明確な仮説を調べることができる。 この例では、うつ病の人がしばしば平均よりも少ない運動をする観測された相関が因果的であるという仮説を検定することができる。 運動がうつ病に対して保護的であるならば、パスDは重要であるべきであり、結果としてより少ないうつ病を示す運動をする双子である。これは、上記のモデリングから見ることができ、双子研究の主な仮定は、また、等しい環境仮定として知られている等しい環境のことです。 この仮定は直接テストされています。 両親が双子が実際に遺伝的に同一であるときに非同一であると信じている特別なケースが発生します。 心理的特徴の範囲の研究は、これらの子供たちが同じようにそれらを扱った親によって育てられたMZ双子として一致していることを示しています。遺伝性推定の分子遺伝学的方法は、古典的な双子の研究よりも低い推定値を生成する傾向があり、古典的な双子の設計の等しい環境の仮定が健全ではないかもしれないという証拠を提供している。 2016年の研究では、双子の出生前の環境が等しいという仮定は大部分が主張可能であると判断された。 研究者は、同等の環境仮定が有効であるかどうかを議論し続けています。

測定された類似性:双子の設計における仮定の直接検定編集

双子の方法をテストするための特に強力な技術はVisscherらによって報告された。 双子を使用する代わりに、このグループは、平均して兄弟が遺伝子の50%を共有するのに対し、個々の兄弟ペアの実際の遺伝子共有はこの値の周りで変化し、本質的に家族内で遺伝的類似性または「双子」の連続体を作成するという事実を利用した。 遺伝子共有の直接推定に基づく遺伝性の推定値は、双子法からの推定値を確認し、方法の仮定を支持する。

性別差edit

遺伝的要因は、遺伝子発現および遺伝子×環境相互作用の範囲の両方において、性別間で異なる可能性がある。 兄弟の異性の双子のペアは、これらの効果を説明する上で非常に貴重です。極端な場合、遺伝子は1つの性別でのみ発現することができます(定性的な性別制限)。

より一般的には、遺伝子対立遺伝子の効果は、個体の性別に依存し得る。 遺伝子は男性では100gの体重変化を引き起こすかもしれませんが、女性ではおそらく150gの体重変化を引き起こす可能性があります–定量的な遺伝子 このような影響は、遺伝子が自分自身を表現する能力に影響を与える可能性があり、性差を介してこれを行う可能性があります。 例えば、投票行動に影響を与える遺伝子は、女性が投票から除外されている場合、女性には影響を及ぼさないであろう。 より一般的には、性差検定の論理は、個人の任意の定義されたサブグループに拡張することができます。 このような場合には、同性と異性の相関関係が異なり、性差の影響を裏切ることになります。このため、3つのタイプの兄弟双生児を区別することは正常です。

標準的な分析ワークフローは、5つのグループ、同一の男性、同一の女性、兄弟の男性、兄弟の女性、および兄弟の異性にモデルをフィッティングすることによ したがって、双子モデリングは相関関係を超えて、性別などの潜在的な因果変数を含む因果モデルをテストします。

遺伝子×環境相互作用編集

遺伝子の効果は、多くの場合、環境に依存していてもよいです。 このような相互作用は、遺伝子対立遺伝子の効果が異なる環境間で異なるG×e相互作用として知られている。 単純な例には、遺伝子が環境の影響を乗算する状況が含まれます:おそらく高栄養環境では高さに1インチを追加しますが、低栄養環境では高さに半 これは、異なる遺伝子型に対する環境への応答の異なる勾配で見られる。

多くの場合、研究者は異なる条件下での遺伝性の変化に興味があります: 対立遺伝子が(上記のように)大きな表現型効果を駆動することができる環境では、これらの環境におけるより高い遺伝性に対応して、遺伝子の相対的な役割が増加するであろう。第二の効果は、特定の対立遺伝子が特定の環境に付随する傾向があるG×E相関である。

遺伝子が親に読書を楽しむようにすると、この対立遺伝子を継承する子供たちは、GE相関のために本を持つ家庭で育てられる可能性が高くなります。 このような効果は、意図された環境相関(この場合は家庭内の本)を直接測定することによってテストすることができる。

多くの場合、環境の役割は人生の非常に早い段階で最大と思われ、義務教育が始まった後に急速に減少します。 これは、例えば、知性と同様に読書で観察されます。 これはG*年齢効果の例であり、親の環境によるGE相関(これらは時間とともに分割されます)と、特定の環境を積極的に求めている個人によって引き起こ

反応の規範編集

植物または動物育種における研究は、実験的に無作為化された遺伝子型および環境の組み合わせの影響を測定するこ 対照的に、人間の研究は、典型的には観察的である。 これは、反応の規範を評価することができないことを示唆している可能性がある。

経済学や疫学などの他の分野と同様に、差動遺伝子共有、反復暴露、環境への測定された暴露(子供の社会的地位、家族の混乱、教育の利用可能性と質、栄養、毒素など)を使用する能力を活用するために、いくつかのデザインが開発されている。)原因のこの交絡に対抗するために。 古典的な対の設計の固有の懇願はこれらの混乱を解き始めることである。 例えば、同一および兄弟姉妹の双子では、非双子の家族性研究のように、環境を共有し、遺伝的影響は混同されない。 したがって、双子の研究は、これらの相関関係を理解するのを助けるために家族のメンバー間の遺伝子のランダムな品揃えを利用しようとする試みに

双子の研究は、遺伝子や家族が環境の観察された範囲内で行動にどのように影響するかだけを教えてくれますが、多くの場合、遺伝子や環境が共分散するという警告がありますが、これは遺伝子や環境のさまざまな役割についての知識ではない代替案よりもかなり進歩しています。 したがって、双対研究は、この観測された分散の少なくとも一部を制御する方法としてよく使用されます: 例えば、以前は家族の環境であると仮定されていたものを、双子の完全かつ部分的に共有されたゲノムの実験を使用して、共有環境および相加遺伝学に分割する。

単一の設計ですべての問題に対処することはできません。 その他の情報は古典的な対の設計の外で利用できる。 採用デザインは、同じ遺伝子型を異なる環境に配置することによって反応の規範をテストする自然実験の一形態です。 関連研究は、例えば、対立遺伝子効果の直接研究を可能にする。 対立遺伝子のメンデル無作為化はまた、それらの関連する環境および他の遺伝子に関して対立遺伝子の効果を無作為に研究する機会を提供する。

拡張された双子のデザインとより複雑な遺伝的モデル編集

基本的または古典的な双子のデザインには、生物学的家族で育てられた同一の兄弟双子のみが含まれています。 これは、可能な遺伝的および環境的関係のサブセットのみを表します。 したがって、双子のデザインからの遺伝性推定値は、行動の遺伝学を理解するための最初のステップを表していると言っても過言ではありません。

相加的な遺伝的、共有、および非共有環境への双子研究の分散分割は、遺伝子-環境共分散および相互作用、ならびに行動に対する他の非相加的効果を考慮した完全な分析への最初の近似である。 分子遺伝学の革命は、ゲノムを記述するためのより効果的なツールを提供しており、多くの研究者は、形質に対する対立遺伝子や環境の影響を直接評価するために分子遺伝学を追求している。

ツインデザインの初期の制限は、共有環境と非加法的な遺伝的影響の両方を同時に考慮する機会がないことです。 この制限は、デザインに追加の兄弟を含めることで対処できます。

第二の制限は、遺伝子-環境相関が明確な効果として検出できないということです。

第二の制限は、遺伝子-環境相関が明確な効果として検出 この制限に対処するには、共通の遺伝的影響と相関しない家族の影響を評価するために、養子縁組モデル、または双子の子供のデザインを組み込む必

連続変数と順序変数編集

コンコーダンス研究は、各双子に存在するか存在しないかのいずれかの形質を比較しながら、相関研究は、双子間で連続的に変化する形質における一致を比較します。