Una versione della canzone è stata inclusa nell’album della colonna sonora del film The Bodyguard, che ha venduto 17 milioni di copie solo negli Stati Uniti. Questa versione è stata eseguita dal cantante jazz Curtis Stigers (che ha anche usato come B-side per il singolo “Sleeping with the Lights On” dal suo omonimo album di debutto, che era stato pubblicato l’anno precedente) e prodotto da Danny Kortchmar. Secondo il libro di Will Birch su pub rock, No Sleep Till Canvey Island, le royalties di copertina della versione di Stigers della canzone hanno reso Lowe ricco. Lowe, tuttavia, afferma che ha usato la maggior parte del denaro per sostenere un tour successivo con la band completa. Stigers ha poi coperto una seconda canzone di Lowe, “You Inspire Me”, nell’album del 2003 con lo stesso nome.
John Lennon cita la canzone nella sua intervista del 1980 a Rolling Stone con Jonathan Cott.
Una versione karaoke della canzone, cantata da Bill Murray, è inclusa nel film Lost in Translation del 2003. Tuttavia, non è stato incluso nella colonna sonora del film.
Nel 2004, “(What’s So Funny ‘bout) Peace, Love and Understanding” è stato regolarmente eseguito come una jam all-star al Vote for Change tour, che ha caratterizzato un cast rotante di headliner. Il concerto dell ‘ 11 ottobre al MCI Center di Washington, D. C. è stato trasmesso in diretta sul Sundance Channel e alla radio. Questa versione della canzone comprendeva Bruce Springsteen e la E Street Band, i Dixie Chicks, Eddie Vedder, Dave Matthews e John Fogerty con Michael Stipe, Bonnie Raitt, Keb’ Mo’ e Jackson Browne.
Nel 2008, è stato utilizzato anche come numero di gruppo, alla chiusura dello speciale di Comedy Central A Colbert Christmas: The Greatest Gift of All! Nel 2007, la band si è esibita in un concerto a New York. Questa performance è stata inclusa nell’album, che ha vinto il Grammy Award 2010 per il miglior album comico.
In risposta alla sparatoria alla sinagoga di Pittsburgh il 27 ottobre 2018, al Tree of Life, la band di Pittsburgh, Pennsylvania, The Clarks ha pubblicato una cover della canzone, con tutti i proventi che vanno alla sinagoga.
Nel maggio 2020, durante la pandemia di corona, Sharon Van Etten e Josh Homme dei Queens of the Stone Age hanno pubblicato una cover della canzone accompagnata da un video ufficiale che è stato girato nelle rispettive case degli artisti. “Volevamo condividere qualcosa di personale e universale. Che siamo tutti in questo tempo insieme”, Van Etten ha scritto sulla copertina. Van Etten in seen si esibisce nel suo giardino come il suo bambino gioca in background. Homme ha eseguito la canzone mentre era seduto su una scala e più tardi in una delle camere da letto della sua casa. I figli del musicista appaiono anche in diverse scene. La grafica del video è stata creata da Matthew Daniel Siskin “via iMessage + telephone”, con compiti di co-regia provenienti da”all the kids”.