Il existe un écart entre le nombre de pierres tombales et le nombre de personnes enterrées dans le Grenier – on estime que plus de 5 000 Bostoniens ont fait du Grenier leur lieu de repos final. À une certaine époque, le grenier faisait partie de Boston Common, et le bétail qui broutait le terrain communal s’occupait également de l’aménagement paysager du cimetière. À l’époque victorienne, les pierres tombales ont été réorganisées en rangées soignées pour faire place à une innovation moderne de l’époque, la tondeuse à gazon.
La tombe du Nourrisson, où des centaines d’enfants ont été inhumés, est située près de l’obélisque central qui marque la tombe des parents de Benjamin Franklin. Le long du mur du fond, un obélisque richement orné marque la tombe de John Hancock. Paul Revere est enterré près de l’arrière du grenier; un grand marqueur placé au 19ème siècle se tient près d’un marqueur d’ardoise plus petit et plus ancien. Des pierres assorties dans les deux coins avant du cimetière commémorent James Otis et Samuel Adams. À côté de la pierre pour Adams se trouve la tombe des victimes du massacre de Boston. Sur le mur de droite se trouve une plaque marquant la tombe de Robert Treat Paine, le troisième signataire de la Déclaration d’indépendance enterré dans le Grenier (les autres étant John Hancock et Samuel Adams).
Les églises puritaines ne croyaient pas aux icônes ou aux images religieuses, de sorte que les habitants de Boston utilisaient les pierres tombales comme un exutoire pour l’expression artistique de leurs croyances sur l’au-delà. L’un des motifs les plus populaires était « l’Effigie de l’âme », un crâne ou une « tête de mort » avec une aile de chaque côté qui était une représentation de l’âme volant au ciel après la mort. Des parchemins élaborés, des épitaphes poétiques et des représentations de la Faucheuse et du Temps du père ornent également de nombreuses pierres tombales.