Les origines exactes de la boysenberry ne sont pas claires, mais les documents les plus précis font remonter la plante telle qu’elle est connue aujourd’hui au producteur Rudolph Boysen, qui a obtenu le parent dewberry–loganberry de la ferme de John Lubben.
À la fin des années 1920, George M. Darrow de l’USDA a commencé à traquer les rapports d’une grande baie rouge-pourpre qui avait été cultivée dans la ferme de Boysen à Anaheim, en Californie. Darrow demanda l’aide de Walter Knott, un autre fermier, connu comme un expert des baies. Knott n’avait jamais entendu parler de la nouvelle baie, mais il accepta d’aider Darrow dans sa recherche.
Darrow et Knott apprirent que Boysen avait abandonné ses expériences de culture plusieurs années auparavant et vendu sa ferme. Non découragés par cette nouvelle, Darrow et Knott se dirigèrent vers l’ancienne ferme de Boysen, sur laquelle ils trouvèrent plusieurs vignes fragiles survivantes dans un champ étouffé par les mauvaises herbes. Ils ont transplanté les vignes à la ferme de Knott à Buena Park, en Californie, où il les a nourries pour qu’elles retrouvent une santé fruitière. Walter Knott fut le premier à cultiver commercialement la baie dans le sud de la Californie.
Il a commencé à vendre les baies sur son stand de ferme en 1932 et a rapidement remarqué que les gens revenaient pour acheter les grosses baies savoureuses. Lorsqu’on lui a demandé comment on les appelait, Knott a dit: « Boysenberries », d’après leur créateur. Le petit restaurant et l’entreprise de tartes de sa famille se sont finalement transformés en Knott’s Berry Farm. Au fur et à mesure que la popularité de la baie augmentait, Mme Knott a commencé à fabriquer des conserves, ce qui a finalement rendu la ferme Knott’s Berry célèbre.
En 1940, 599 acres (242 ha) de terres en Californie étaient dédiés aux baies de boysen. Le nombre a reculé pendant la Seconde Guerre mondiale, mais a culminé à nouveau dans les années 1950 à environ 2 400 acres, au point où les cultures de baies de boysen ont dépassé celles des framboises et des mûres (auparavant) plus courantes. Dans les années 1960, le boysenberry a commencé à tomber en disgrâce en raison d’une combinaison d’être difficile à cultiver, sensible aux maladies fongiques dans les zones de culture côtières, et trop doux et délicat pour être facilement expédié sans dommage, ainsi que d’une courte saison de disponibilité par rapport aux cultivars plus récents. Dans les années 1980, les efforts de sélection en Nouvelle-Zélande ont combiné des cultivars et du matériel génétique de Californie avec des sources écossaises pour créer cinq nouvelles variétés sans épines.
Au début des années 2000, les baies de boysen fraîches étaient généralement cultivées uniquement pour le marché par de petits agriculteurs californiens et vendues dans les stands et les marchés locaux. La plupart des baies de boysen cultivées dans le commerce, principalement en provenance de l’Oregon, sont transformées en d’autres produits tels que la confiture, la tarte, le jus, le sirop et la crème glacée. En 2016, la Nouvelle-Zélande était le plus grand producteur et exportateur mondial de baies de boysen.