Dans le cadre de vos recherches, vous lisez un article qui mentionne les souris BALB/c. Vous traquez cette souris dans la base de données des souris JAX®, et vous vous demandez quelle souris BALB/c les chercheurs ont utilisée – BALB/cJ(000651) ou BALB/cByJ (001026). Quelle est la différence (le cas échéant) et laquelle devriez-vous utiliser pour vos recherches?
Sous-domaines : comment ça, ils ne se ressemblent pas tous ?
Commençons à répondre à cette question en examinant brièvement quelles sont les sous-matières. Une sous-traction peut survenir de deux manières: 1) lorsqu’une mutation spontanée se fixe dans une colonie et que cette colonie est maintenue en tant que lignée distincte, 2) lorsque des souris de la même colonie mère sont maintenues séparément pendant 20 générations ou plus. Concentrons-nous sur la deuxième voie. Supposons que vous et moi ayons obtenu des souris BALB / c de la même source. Si ma colonie se reproduit depuis 11 générations et que la vôtre se reproduit depuis neuf générations, nos deux colonies sont techniquement des sous-domaines l’une de l’autre. Pourquoi? Parce qu’ils sont séparés de 20 générations (11 + 9) et, pendant ce temps, des mutations spontanées entraînant des différences phénotypiques uniques peuvent s’être développées.
De même, la souche originale BALB/c s’est séparée en deux sous-souches principales (BALB/cJ et BALB/cByJ) en 1935. Plus de détails sur le développement historique de ces deux sous-domaines peuvent être trouvés dans Potter et al. 1985 (Histoire de la famille BALB / c, Sujets Curr Microbiol Immunol. 122:1-5), le site Web d’informatique du Génome de la Souris, les origines des Souris consanguines, et dans le Manuel sur les souris JAX génétiquement normalisées. Bien que étroitement liés, BALB / cJ et BALB /cByJ ne sont pas identiques.
Les différences génétiques font toute la différence
Les différences génétiques connues entre ces deux sous-souches comprennent au moins trois mutations dans la souche BALB/cByJ: 1)Acadsdel-J (acyl-Coenzyme A déshydrogénase, chaîne courte) et 2) Ahrb-2 (récepteur aryl-hydrocarbure). Bien que ces deux souches soient considérées comme appariées au Complexe majeur d’histocompatibilité (CMH) (elles ont l’haplotype H2d) et que des tissus puissent être transplantés entre souches, le locus de classe 1b de BALB/cByJ contient une délétion inQa-2 sur le chromosome 17 (Mellor, A., et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA 82:5920, 1985). Pour des variations supplémentaires entre les sous-chaînes BALB/c maintenues dans le monde entier, voir La souris BALB/c. Génétique et immunologie, M. Potter (ed.), Sujets d’actualité dans une Microbiologie et immunologie 122, Springer-Verlag, 1985.
Différences phénotypiques: tu n’es pas la souche que je connaissais avant!
Comme on peut s’y attendre de deux souches qui se reproduisent séparément depuis 1935, BALB/cJ et BALB/cByJ présentent de nombreuses différences phénotypiques. BALB / cByJ a une performance reproductive plus élevée et est moins agressif que BALB / CJ. Les femelles BALB / cByJ sont de bonnes mères et sont couramment utilisées comme mères nourricières. Les souris BALB / cByJ présentent une calcinose cardiaque dystrophique spontanée, des acides gras libres élevés, des taux élevés de triglycérides et un certain nombre d’anomalies hématologiques. D’autres phénotypes entre ces souches sont comparés dans la Base de données sur les phénomes de souris.
Sélection des sous-domaines: et le gagnant est…
Maintenant que vous savez que les sous-domaines de BALB/c existent, c’est l’heure de la décision. En fin de compte, le choix de la sous-chaîne BALB / c la mieux adaptée à votre recherche dépend d’un certain nombre de facteurs. Si vous essayez de répéter ou de vous appuyer sur des expériences précédentes, faites tout votre possible pour identifier et utiliser la même souche. De cette façon, vous éviterez d’introduire des différences de fond génétique et de phénotype. Ajouter une nouvelle variable à votre conception expérimentale est la dernière chose que vous voulez faire. Il est déjà assez difficile d’obtenir des résultats statistiquement significatifs! Si vous commencez une nouvelle ligne de recherche, considérez le comportement, les performances de reproduction et les caractéristiques génétiques et phénotypiques documentées des deux sous-souches.