The Taggart Baking Company de Indianápolis, Indiana, comenzó a producir un debut el 21 de mayo de 1921, después de una promoción a ciegas con anuncios que solo indicaban que una «Maravilla» vendría en esa fecha. La marca fue nombrada por el vicepresidente de desarrollo de merchandising, Elmer Cline, quien se inspiró en la Carrera Internacional de Globos Aerostáticos en el circuito de Indianápolis. Cline se llenó de» maravilla » con la escena de cientos de globos creando un caleidoscopio de color que resultó en los icónicos globos rojos, amarillos y azules que aparecen en el logotipo de Wonder Bread. El logotipo fue diseñado por el artista comercial Drew Miller mientras trabajaba en una agencia de publicidad de Chicago.
Continental Baking Company compró Taggart en 1925. Esto hizo de Wonder Bread una marca nacional y agregó «Está cocido al horno» al logotipo. En la década de 1930, Continental Baking comenzó a comercializar Wonder Bread en rodajas en todo el país, una de las primeras empresas en hacerlo; este fue un hito importante para la industria y para los consumidores estadounidenses, que, al principio, necesitaban la seguridad de que el pan «cortado de maravilla» no se secaría. La W. E. Long Company de Chicago, que había formado una cooperativa de panaderías para comercializar pan Holsum, había sido pionera y promovido el envasado de pan rebanado dos años antes, en 1928. El pan sin rebanar regresó durante un período durante la Segunda Guerra Mundial debido a una escasez de acero que llevó a una suspensión de rebanado en toda la industria en 1943. Las cortadoras de pan regresaron dos años después.
Durante la década de 1940, Continental Baking comenzó a agregar vitaminas y minerales al Pan Wonder como parte de un programa de enriquecimiento patrocinado por el gobierno pan blanco, que era notoriamente deficiente en vitaminas y minerales, para combatir ciertas enfermedades. Wonder también fue la primera marca nacional de pan en presentar citas abiertas, así como información nutricional en su empaque. En la década de 1950, Wonder Bread amplió aún más la publicidad de sus enriquecimientos de nutrientes. La compañía patrocinó Howdy Doody con el anfitrión Buffalo Bob Smith diciendo a la audiencia: «Wonder Bread construye cuerpos fuertes de 8 maneras. Busca los globos rojos, amarillos y azules impresos en la envoltura.»En la década de 1960, Wonder Bread se anunciaba con el eslogan «Ayuda a construir cuerpos fuertes de 12 maneras», en referencia al número de nutrientes añadidos. En 1986, Continental introdujo el pan ligero de bajo contenido calórico Wonder Light bread.
Interstate Bakeries Corporation, más tarde conocida como first Hostess Brands Company (Antigua HB), compró Continental Baking en 1995. En 2004, las Panaderías Interestatales se declararon en bancarrota, poniendo en duda el futuro del Pan de maravilla. En febrero de 2009, las panaderías Interestatales salieron de la bancarrota marcando un «nuevo comienzo» para la compañía de panificación.
En 2006, Wonder fue una de las primeras marcas de pan en introducir panes blancos integrales, como «Wonder Made with Whole Grain White», como un pan que atraía a los consumidores que amaban el sabor del pan blanco, pero que buscaban más nutrición.Estos panes se hicieron con una variedad de trigo albino que no tiene el sabor más pronunciado de la harina de trigo rojo integral.
El 28 de agosto de 2007, Interstate Bakeries anunció que pronto terminaría la producción de Wonder Bread en el mercado del sur de California, lo que pérdida de 1.300 empleos. Esto se debió al fallo en una demanda por discriminación racial de 1 121 millones y a una disminución en las ventas, ya que los californianos del Sur en particular eran parciales a los panes integrales y los panes «premium». A partir de septiembre de 2009, Wonder Bread y otras marcas de panes de Hostess, como Home Pride, regresaron a los supermercados del sur de California en respuesta a la importante demanda de los consumidores. En relación con la reintroducción, la compañía donó miles de panes al Banco de Alimentos de San Diego y al Banco Regional de Alimentos de Los Ángeles.
En agosto de 2009, Wonder reformuló sus variedades de pan sándwich Wonder Classic y Wonder Classic para incluir más calcio y vitamina D. Dos rebanadas de pan sándwich Wonder Classic y Wonder Classic proporcionaron el 30% de la ingesta diaria recomendada de calcio, la misma cantidad que 8 onzas líquidas de leche entera. Wonder 100% Trigo Integral (variedad de 16 onzas) calificado para el programa de Mujeres, Bebés y Niños (WIC) en la mayoría de los estados. En marzo de 2010, Wonder amplió su línea de productos de pan para familias que preferían el sabor del pan blanco, pero querían más nutrición, con la adición de Wonder Smartwhite, un nuevo pan con el sabor y la textura suave del pan blanco, pero con la fibra del pan integral 100%.
En 2011, Wonder bread lanzó su primera campaña publicitaria nacional en años titulada «Always Wonder».
El 16 de noviembre de 2012, Hostess Brands (Old HB) presentó una moción en el Tribunal de Quiebras de los Estados Unidos para el Distrito Sur de Nueva York solicitando permiso para cerrar su negocio y vender sus activos bajo el Capítulo 11. El 16 de noviembre de 2012, Hostess Brands (Old HB) cerró sus plantas en los Estados Unidos y comenzó los procedimientos de liquidación, terminando temporalmente la producción de Wonder Bread en los Estados Unidos. Flowers Foods, dueña del Mrs. Freshleys, Tastykake y Dave’s Killer Bread Brands, anunciaron que firmaron un acuerdo para adquirir las marcas de pan de Hostess, incluido Wonder Bread, el 11 de enero de 2013. El 22 de julio de 2013, Flowers Foods completó su adquisición de bre 355 millones de varios panes, panaderías y otros activos de la compañía anteriormente conocida como Hostess Brands (Old HB), incluido Wonder Bread. Flowers Foods anunció el 12 de septiembre de 2013 que Wonder Bread volvería a los estantes de las tiendas de los Estados Unidos, con la entrega de Wonder Bread a las tiendas reanudándose el 23 de septiembre.