Mohammad Ayub Khan, (nacido el 14 de mayo de 1907, Hazāra, India—fallecido el 19 de abril de 1974, cerca de Islāmābād, Pakistán.), presidente de Pakistán de 1958 a 1969, cuyo gobierno marcó un período crítico en el desarrollo moderno de su nación.
Después de estudiar en la Universidad Musulmana Alīgarh, en Uttar Pradesh, India, y en el Real Colegio Militar Británico, en Sandhurst, Ayub Khan fue comisionado oficial en el ejército indio (1928). En la Segunda Guerra Mundial fue segundo al mando de un regimiento en Birmania (Myanmar) y comandó un batallón en la India. Después de la partición de la India británica en 1947, fue ascendido rápidamente en el ejército del nuevo estado musulmán de Pakistán: de mayor general (1948) a comandante en jefe (1951). Además, Ayub se convirtió en ministro de defensa (1954) por un breve período.
Después de varios años de agitación política en Pakistán, en 1958 el presidente Iskander Mirza, con el apoyo del ejército, derogó la constitución y nombró a Ayub administrador jefe de la ley marcial. Poco después, Ayub se declaró presidente, y Mirza fue exiliado. Ayub reorganizó la administración y actuó para restaurar la economía a través de reformas agrarias y el estímulo de la industria. También se alentaba la inversión extranjera.
Ayub introdujo el sistema de «democracias básicas» en 1960. Consiste en una red de órganos autónomos locales para establecer un vínculo entre el gobierno y el pueblo. Se establecieron unidades de gobierno primarias para dirigir los asuntos locales; sus miembros fueron elegidos por circunscripciones de 800 a 1.000 adultos. Un referéndum nacional entre todos los elegidos confirmó a Ayub como presidente. Fue reelegido bajo este sistema en 1965, contra un fuerte desafío de una oposición unida detrás de Fátima Jinnah, la hermana de Mohammed Ali Jinnah, el creador de Pakistán.
Cuando los Estados Unidos comenzaron a rearmar a la India después de la invasión china del norte de la India en 1962, Ayub estableció estrechas relaciones con China y recibió una importante ayuda militar de ella. Mientras tanto, la disputa de Pakistán con la India sobre Jammu y Cachemira empeoró, culminando con el estallido de la guerra en 1965. Después de dos semanas de lucha, ambas partes acordaron un alto el fuego de las Naciones Unidas y llegaron a un acuerdo fronterizo.
El fracaso para ganar Cachemira, combinado con el malestar estudiantil por las restricciones del sufragio, intensificó la agitación interna que a finales de 1968 Ayub anunció que no se presentaría a la reelección. Los disturbios continuaron, y renunció a su cargo el 26 de marzo de 1969, para ser sucedido por el General Yahya Khan, comandante en jefe del ejército.