Las islas de Filipinas están organizadas en tres grupos de islas distintos según las regiones: Luzón comprende las Regiones I a V, CAR y NCR; Visayas comprende las Regiones VI a VIII; y Mindanao comprende las Regiones IX a XIII y BARMM. Si una provincia es reasignada a una nueva región, también puede ser reasignada a un nuevo grupo de islas, como es el caso de Palawan, cuando fue asignada temporalmente de Mimaropa a las Visayas Occidentales y, por lo tanto, temporalmente se consideró parte de las Visayas.
Los grupos de islas no tienen gobiernos propios, sino que se dividen en provincias, ciudades, municipios y barangays, que tienen sus propios gobiernos locales. Los grupos de islas se utilizan para facilitar las estadísticas y, en algunos casos, hay organismos gubernamentales nacionales que han creado puestos que abarcan a los grupos de islas, como el Subsecretario de Operaciones Regionales en Mindanao, en el Departamento de Obras Públicas y Carreteras, o el Subsecretario de Asuntos de Luzón, en el Departamento de Bienestar Social y Desarrollo.
Aunque los grupos insulares no tienen gobiernos locales, por lo tanto capitales, ciertas ciudades se han convertido en los centros políticos, económicos y culturales de los grupos insulares. Manila es la capital nacional y es la capital de facto de Luzón, aunque la vecina Ciudad de Quezón, una antigua capital, tiene más habitantes que Manila. Cebú, en la provincia e isla del mismo nombre, es la ciudad principal de las Visayas. La ciudad principal de Mindanao es Davao, hacia su sureste.