Andrew Wilson se inspiró en los famosos duck tours de Wisconsin Dells, Wisconsin. La compañía comenzó a realizar giras en Boston con cuatro Patos y ahora dirige una flota de 28. El primer lugar de salida fue en Long Wharf, frente al Acuario de Nueva Inglaterra. En 1997, la operación de Boston Duck Tours se trasladó al barrio de Back Bay de Boston en el Prudential Center. En 2002, Boston Duck Tours abrió un segundo lugar de salida y venta de boletos en el Museo de la Ciencia. En 2009, Boston Duck Tours abrió un tercer lugar de salida y venta de boletos en el Acuario de Nueva Inglaterra. Boston Duck Tours transporta aproximadamente 600,000 pasajeros por año.
Un Boston Duck Tour DUKW en el río Charles
En 2002, los Patos del Boston Duck Tour se utilizaron por primera vez como vehículos de desfile para los New England Patriots después de que los Patriots ganaran el Super Bowl XXXVI sobre los St.Louis Rams. Desde entonces, los patos del Boston Duck Tour han participado en 12 desfiles de campeonatos deportivos profesionales en Boston. Ha habido seis para los Patriotas de Nueva Inglaterra(2002, 2004, 2005, 2015, 2017, 2019), cuatro para los Medias Rojas de Boston (2004, 2007, 2013, 2018), uno para los Boston Celtics (2008), y otro para los Boston Bruins (2011). Con estos desfiles que se han convertido en una ocurrencia frecuente desde 2002,» Cue the Duck Boats » se ha convertido en un eslogan popular en Boston entre los fanáticos de los deportes de la ciudad. Los Duck Boats fueron planeados por primera vez para ser utilizados por los New England Patriots en 1997, sin embargo, no ganaron el Super Bowl XXXI. Mientras que muchas de las rutas de desfile a lo largo de los años consistían en que los DUKWs permanecieran en tierra, algunos presentaban a los DUKWs atravesando la tierra y cruzando el río Charles.
En 2010, se le pidió a Boston Duck Tours que ayudara a transportar a las víctimas de las inundaciones en Wayland, MA. Las lluvias torrenciales habían dejado aislada la zona de Wayland de la isla Pelham y los Patos fueron traídos para transportar a la gente dentro y fuera de su vecindario hasta que las aguas retrocedieron.
El 7 de agosto de 2014, Boston Duck Tours retiró su último DUKW original de la Segunda Guerra Mundial de las giras programadas regularmente. A partir de 2015, todos los recorridos regulares se realizan en réplicas de DUKWs que son más grandes y fáciles de reparar que los vehículos originales, y funcionan con biodiésel.