Conjuntos de datos moleculares y el uso creciente de la sistemática integradora está revelando diversidad críptica en una serie de taxones, particularmente en paisajes remotos y mal muestreados como la isla de Nueva Guinea. Las pitones verdes (complejo Morelia viridis) son uno de los elementos más llamativos de la fauna de esta isla, con un gran número de ejemplares extraídos de la naturaleza para abastecer la demanda internacional de mascotas exóticas. Probamos hipótesis sobre los límites de las especies en pitones verdes de Nueva Guinea y Australia con genomas mitocondriales, 389 exones nucleares y una evaluación exhaustiva de la variación morfológica. La fuerte estructuración genética de las poblaciones de pitón verde y los métodos de delimitación de especies confirman la presencia de dos especies, que se encuentran ampliamente al norte y al sur de las montañas centrales de Nueva Guinea. Nuestros datos también apoyan tres subespecies dentro de la especie del norte. La divergencia morfológica sutil pero consistente entre los supuestos taxones es concordante con los patrones de divergencia molecular. Nuestro extenso muestreo identifica varias zonas de importancia biogeográfica hasta ahora desconocida en la isla de Nueva Guinea. Revisamos la taxonomía del grupo, discutimos la relevancia de nuestros hallazgos en el contexto de la biogeografía papú y las implicaciones de nuestros cambios sistemáticos para la gestión de la conservación de estos taxones.
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