La familia Barrett—madre Lacy, padre Daniel, hijo mayor Jesse y hijo menor Sammy—residen en una tranquila calle suburbana en una ciudad estadounidense sin nombre. Daniel está actualmente desempleado, por lo que la carga de mantener a la familia recae en Lacy, que trabaja como agente de bienes raíces. Sus dos hijos disfrutan de una relación feliz y se comunican entre sí desde sus camas a través de un walkie-talkie.
Una serie de sucesos extraños ocurren a la familia. Durante la noche, el contenido de la cocina se reorganiza en configuraciones extrañas. La alarma de la casa se activa cuando detecta que todos los puntos de entrada se violaron simultáneamente. Sammy sufre un ataque mientras está en una piscina y Lacy se sorprende cuando cientos de pájaros chocan repentinamente contra la casa. Una noche, Lacy es despertada por un sonido de la habitación de Sammy. Cuando va a ver cómo está, a través de la oscuridad ve una figura de pie sobre su cama. Enciende la luz para encontrar una habitación vacía. Sammy se encuentra alejándose de la casa, pero no recuerda haberse ido. Lacy, Daniel y Jesse sufren episodios catatónicos y recuperan la conciencia sin recordar sus experiencias. Símbolos extraños se encuentran en los cuerpos de Jesse y Sammy.
Muy perturbada por los diversos fenómenos que afligen a la familia y la casa, Lacy comienza a buscar respuestas en línea y encuentra artículos que atribuyen parte de lo que han experimentado a ovnis e informes de abducción alienígena. Daniel instala cámaras de seguridad por toda la casa. Daniel y Lacy experimentan episodios de apagón por separado. Se descubre que Sammy tiene marcas en su cuerpo en una fiesta en la piscina. Jesse experimenta un episodio en el bosque con Ratner y es admitido en el hospital donde los médicos descubren formas geométricas en su cuerpo. Los médicos reportan las marcas a los Servicios de Protección Infantil. En otro episodio nocturno, Daniel revisa las imágenes de la noche y el análisis cuadro por cuadro revela tres figuras oscuras de pie sobre sus camas mientras dormían. Ahora, creyendo que hay una fuerza extraterrestre trabajando, Lacy y Daniel buscan la ayuda de un especialista, Edwin Pollard, que llama a los seres «los Grises». Pollard les informa que muchos otros han sufrido el mismo destino que los Barret, con la mayoría de los casos terminando en un secuestro de niños. Edwin advierte a los Barret que la persona en la que los Grises muestran interés por primera vez es generalmente la que es secuestrada y que deben ser altamente protectores de Sammy, a quien cree que ha sido «elegido».»
Daniel compra una escopeta mientras que Lacy compra un perro guardián agresivo. La familia pasa el 4 de julio en las ventanas de la casa, luego cenan y recuerdan tiempos más felices. De repente, las luces de la casa comienzan a parpadear y el perro comienza a ladrar ferozmente. Lacy envía a los chicos arriba y hace guardia fuera de la puerta. Lacy escucha el televisor de su habitación encenderse. Ella camina hacia él, sin saber de un ser que está de pie directamente detrás de ella, y queda atrapada en su habitación. Daniel lleva a Jesse y Sammy a su habitación y a la de Lacy, donde se atrincheran y se acurrucan en la cama. El televisor comienza a parpadear de nuevo y los seres, ahora revelados como Grises, se materializan en la habitación. Jesse se desmaya y experimenta una alucinación en la que su padre se suicida junto al cuerpo ensangrentado de su madre. Al ver a su hermano, Jesse persigue a Sammy antes de despertar en el pasillo de arriba de su casa. Los Grises aparecen frente a él y desaparece con ellos en un destello de luz, el resto de la familia sin poder ayudar.
Tres meses después, Lacy y Daniel son sospechosos en el caso de desaparición de Jesse y se han mudado a un apartamento. Pollard recorta un artículo de periódico sobre la desaparición de Jesse y lo cuelga en su pared con otras fotos de niños desaparecidos. A medida que Lacy pasa por cosas viejas, encuentra imágenes que Jesse dibujó de niño que muestran los Grises que lo rodean. Tardíamente se da cuenta de que fue Jesse, no Sammy, en quien los Grises mostraron interés por primera vez, y que él era el que había sido elegido. La retroalimentación emana de un walkie-talkie cercano mientras Lacy y Sammy escuchan la débil voz de Jesse llamando el nombre de Sammy con terror y dolor.