Tren interurbano y de cercanías
El Centro de Tránsito de la Ciudad Vieja alberga trenes de pasajeros que operan en la ruta de tren interurbano Pacific Surfliner de Amtrak y en la línea de tren de cercanías COASTER. De los 22 trenes Amtrak Pacific Surfliner que operan en San Diego, 18 de ellos se detienen en el Centro de Tránsito de Old Town, aunque los trenes Surfliner que operan en Old Town no ofrecen servicio de equipaje facturado, y se detienen en Old Town para abordar pasajeros (trenes hacia el norte) o distraer pasajeros (trenes hacia el sur), respectivamente.
El número de pasajeros de Amtrak en el Centro de Tránsito de Old Town se ha disparado en los últimos dos años. En el Año Fiscal 2011, hubo solo 22.867 embarques y detraimientos en Old Town (lo que representó un aumento del 5,79% con respecto al Año Fiscal 2010). En el Año Fiscal 2012, los embarques y detraimientos en Old Town aumentaron a 61,118, un aumento del 167% con respecto al año fiscal 2011. A partir del Año Fiscal 2013, la cifra de pasajeros de Amtrak ha seguido aumentando, a 135,749 abordajes y detraimientos, un aumento adicional del 122% con respecto al año fiscal 2012. (Ha habido una disminución correspondiente en los embarques de Amtrak en el Depósito de Santa Fe en el centro de San Diego durante este mismo período, lo que posiblemente indica que algunos embarques de Amtrak se han trasladado del Depósito de Santa Fe al Casco Antiguo en los últimos dos años. De las 74 estaciones de California servidas por Amtrak, el Centro de Tránsito de Old Town fue el número 25 con mayor actividad en el Año Fiscal 2013, embarcando o desentrenando a un promedio de aproximadamente 372 pasajeros al día.
Trolley de San Diego
Old Town Transit Center es también una estación de tren ligero en la línea verde del Tranvía de San Diego. Esta estación originalmente sirvió como terminal de esa línea, hasta que un realineamiento del sistema en septiembre de 2012 extendió la Línea Verde a través del Casco Antiguo hasta el centro de San Diego.
Una vez que se complete la extensión de Mid-Coast del Tranvía, la Línea Azul se volverá a extender a través de esta estación para servir al área de la Ciudad Universitaria, por lo que la Línea Azul volverá a servir al Casco Antiguo aproximadamente en 2021. En julio de 2015, se anunció un acuerdo de derechos de denominación de 30 años entre MTS y UC San Diego Health; como resultado de este acuerdo, la Línea Azul pasará a llamarse «Línea Azul de UC San Diego» y el Centro de Tránsito de Old Town se convertirá en «Old Town UC San Diego Health South».
Servicio de buseditar
Old Town también funciona como un centro de tránsito de autobuses para las rutas del Sistema de Tránsito Metropolitano de San Diego 8, 9, 10, 28, 30, 35, 44, 88, 105, y 150. Hay un túnel peatonal subterráneo que une las terminales de autobuses a ambos lados de la estación con las áreas de tranvía/tren. El casco antiguo también cuenta con un servicio de transporte a la Universidad de California, San Diego y la Universidad de San Diego.