Los orígenes exactos de la baya boysen no están claros, pero los registros más definitivos rastrean la planta tal como se la conoce hoy en día hasta el cultivador Rudolph Boysen, quien obtuvo la baya de rocío–baya logan de la granja de John Lubben.
A finales de la década de 1920, George M. Darrow del USDA comenzó a rastrear informes de una baya grande de color púrpura rojizo que se había cultivado en la granja Boysen en Anaheim, California. Darrow contó con la ayuda de Walter Knott, otro granjero, conocido como un experto en bayas. Knott nunca había oído hablar de la nueva baya, pero accedió a ayudar a Darrow en su búsqueda.
Darrow y Knott se enteraron de que Boysen había abandonado sus experimentos de cultivo varios años antes y vendido su granja. Impávidos ante esta noticia, Darrow y Knott se dirigieron a la antigua granja de Boysen, en la que encontraron varias viñas frágiles que sobrevivían en un campo ahogado con malas hierbas. Trasplantaron las vides a Knott’s Farm en Buena Park, California, donde las cuidó de nuevo para que tuvieran una salud fructífera. Walter Knott fue el primero en cultivar comercialmente la baya en el sur de California.
Comenzó a vender las bayas en su puesto de granja en 1932 y pronto se dio cuenta de que la gente seguía regresando para comprar las bayas grandes y sabrosas. Cuando se les preguntó cómo se llamaban, Knott dijo, «Boysenberries», por su creador. El pequeño restaurante y negocio de pasteles de su familia eventualmente se convirtió en Knott’s Berry Farm. A medida que la popularidad de la baya creció, la señora Knott comenzó a hacer conservas, lo que finalmente hizo famosa a Knott’s Berry Farm.
En 1940, 599 acres (242 ha) de tierra en California estaban dedicados a las bayas de boysen. El número disminuyó durante la Segunda Guerra Mundial, pero volvió a alcanzar su punto máximo en la década de 1950 en aproximadamente 2,400 acres, hasta el punto en que los cultivos de bayas de boysen superaron a los de la frambuesa y mora (anteriormente) más comunes. En la década de 1960, la baya de boysen comenzó a caer en desgracia debido a una combinación de ser difícil de cultivar, susceptible a enfermedades fúngicas en áreas de cultivo costeras, y demasiado suave y delicada para enviarse fácilmente sin daños, además de tener una corta temporada de disponibilidad en comparación con cultivares más nuevos. En la década de 1980, los esfuerzos de mejoramiento en Nueva Zelanda combinaron cultivares y germoplasma de California con fuentes escocesas para crear cinco nuevas variedades sin espinas.
A principios de la década de 2000, las bayas de boysen frescas generalmente solo se cultivaban para el mercado por agricultores más pequeños de California y se vendían en puestos y mercados de granjas locales. La mayoría de las bayas de Boysen cultivadas comercialmente, principalmente de Oregón, se procesan en otros productos como mermelada, pastel, jugo, jarabe y helado. A partir de 2016, Nueva Zelanda era el mayor productor y exportador de bayas de boysen del mundo.