Como parte de su investigación, leyó un artículo que menciona ratones BALB/c. Uno rastrea ese ratón en la Base de datos de ratones JAX® y se pregunta qué ratón BALB / c usaron los investigadores: BALB/cJ (000651) o BALB / cByJ (001026). ¿Cuál es la diferencia (si la hay), y cuál debe usar para su investigación?
Sustratos: ¿a qué te refieres con que no son todos iguales?
Comencemos a responder a esta pregunta repasando brevemente qué son los sustratos. Un sustrato puede surgir de un par de maneras: 1) cuando una mutación espontánea se fija en una colonia, y esa colonia se mantiene como una línea separada, 2) cuando los ratones de la misma colonia progenitora se mantienen por separado durante 20 generaciones o más. Centrémonos en la segunda forma. Supongamos que tú y yo obtuvimos ratones BALB / c de la misma fuente. Si mi colonia se ha estado reproduciendo durante 11 generaciones, y la tuya se ha estado reproduciendo durante nueve generaciones, nuestras dos colonias son técnicamente sustratos el uno del otro. ¿Por qué? Debido a que tienen 20 generaciones (11 + 9) de diferencia, y, durante ese tiempo, se pueden haber desarrollado mutaciones espontáneas que resultan en diferencias fenotípicas únicas.
De manera similar, la cepa BALB/c original se separó en dos sustratos principales (BALB/cJ y BALB/cByJ) en 1935. Más detalles sobre el desarrollo histórico de estos dos sustratos se pueden encontrar en Potter et al. 1985 (Historia de la familia BALB / c, Temas Curr Microbiol Immunol. 122:1-5), el sitio web de Informática del Genoma del Ratón, los Orígenes de los Ratones Endogámicos, y en el Manual sobre Ratones JAX Genéticamente Estandarizados. Aunque estrechamente relacionados, BALB / cJ y BALB / cByJ no son idénticos.
Las diferencias genéticas marcan toda la diferencia
Las diferencias genéticas conocidas entre estos dos sustratos incluyen al menos tres mutaciones en la cepa BALB/cByJ: 1) Acadsdel-J (acil-Coenzima A deshidrogenasa de cadena corta) y 2) Ahrb-2 (receptor aril-hidrocarburo). Aunque estas dos cepas se consideran compatibles en el Complejo Mayor de Histocompatibilidad (MHC) (tienen el haplotipo H2d) y los tejidos se pueden trasplantar entre cepas, el locus de clase 1b en BALB/cByJ contiene una deleción inQa-2 en el cromosoma 17 (Mellor, A., et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA 82:5920, 1985). Para variaciones adicionales entre sustratos BALB/c mantenidos en todo el mundo, consulte El Ratón BALB/c. Genetics and Immunology, M. Potter (ed.), Current Topics in a Microbiology and Immunology 122, Springer-Verlag, 1985.
diferencias Fenotípicas: ¡no eres la cepa que conocía antes!
Como es de esperar de dos cepas que se han estado reproduciendo por separado desde 1935, BALB/cJ y BALB/cByJ tienen numerosas diferencias fenotípicas. BALB / cByJ tiene un mayor rendimiento reproductivo y es menos agresivo que BALB / cJ. Las hembras BALB / cByJ son buenas madres y se usan comúnmente como madres de acogida. Los ratones BALB/cByJ tienen calcinosis cardíaca distrófica espontánea, ácidos grasos libres elevados, niveles altos de triglicéridos y una serie de anomalías hematológicas. Otros fenotipos entre estas cepas se comparan en la Base de datos de fenomas de ratón.
Selección de sustratos: y el ganador es
Ahora que sabes que existen sustratos de BALB / c, es el momento de tomar una decisión. En última instancia, elegir qué sustrato de BALB/c es el más adecuado para su investigación depende de una serie de factores. Si está intentando repetir o aprovechar experimentos anteriores, haga todo lo posible para identificar y utilizar la misma cepa. De esa manera, evitarás introducir diferencias en el origen genético y el fenotipo. Agregar una nueva variable a su diseño experimental es lo último que desea hacer. ¡Ya es bastante difícil obtener resultados estadísticamente significativos! Si está comenzando una nueva línea de investigación, considere el comportamiento, el rendimiento reproductivo y las características genéticas y fenotípicas documentadas de los dos sustratos.