dessa kristallers geologiska historia började för cirka 500 miljoner år sedan i ett grunt hav som fick sediment från de gamla Adirondackbergen i norr. Kalcium-och magnesiumkarbonatsedimenten ackumulerades och litifierades för att bilda dolomit berggrunden som för närvarande kallas Little Falls Formation och tidigare som Little Falls Dolostone. Under begravningen bildades håligheter av sura vatten som bildade de vugs i vilka kvartskristallerna bildades. Medan dolomitenheten är kambrisk i ålder tolkas kvartsen inom vugs att ha bildats under Karboniferperioden. Vaxartat organiskt material, kiseldioxid och pyrit (järnsulfid) var närvarande som mindre beståndsdelar av sten gjord av dolomit och kalcit. När sedimentet begravde berget och temperaturen steg växte kristaller i hålrummen mycket långsamt, vilket resulterade i kvartskristaller med exceptionell klarhet. Inneslutningar kan hittas i dessa kristaller som ger ledtrådar till ursprunget till Herkimer diamanter. Finns inom inneslutningarna är fasta ämnen, vätskor (saltvatten eller petroleum), gaser (oftast koldioxid), två – och trefasinslutningar och negativa (uniaxiella) kristaller. Ett svart kolväte är den vanligaste fasta inkluderingen.