som en del av din forskning läser du en artikel som nämner BALB/c-möss. Du spårar ner den musen i Jax ubic Mice – databasen, och du undrar vilken BALB/c-mus forskarna använde-BALB/cJ (000651) eller BALB/cByJ (001026). Vad är skillnaden (om någon), och vilken ska du använda för din forskning?
Substrains: vad menar du att de inte är alla lika?
låt oss börja svara på denna fråga genom att kortfattat granska vilka substrains som är. En substrain kan uppstå på ett par sätt: 1) när en spontan mutation fixas i en koloni, och den kolonin upprätthålls som en separat linje, 2) när möss från samma moderkoloni upprätthålls separat i 20 generationer eller mer. Låt oss fokusera på det andra sättet. Antag att du och jag fick BALB/c-möss från samma källa. Om min koloni har avlat i 11 generationer, och din har avlat i nio generationer, är våra två kolonier Tekniskt subtrains av varandra. Varför? Eftersom de är 20 generationer (11 + 9) från varandra, och under den tiden kan spontana mutationer som resulterar i unika fenotypiska skillnader ha utvecklats.
På samma sätt separerades den ursprungliga BALB / c-stammen i två stora substrains (BALB/cJ och BALB/cByJ) tillbaka 1935. Mer detaljer om den historiska utvecklingen av dessa två substrains finns i Potter et al. 1985 (historia av BALB / c-familjen, Curr ämnen Mikrobiol Immunol. 122: 1-5), Musgenomets Informatikwebbplats, ursprunget till inavlade Möss och i handboken om genetiskt standardiserade Jax-möss. Även om de är nära besläktade är BALB / cJ och BALB/cByJ inte identiska.
genetiska skillnader gör hela skillnaden
kända genetiska skillnader mellan dessa två substrainer inkluderar minst tre mutationer i BALB / cByJ-stammen: 1) Acadsdel-J (acyl-koenzym A-dehydrogenas, kort kedja) och 2) Ahrb-2 (aryl-kolvätereceptor). Även om dessa två stammar anses vara matchade vid det stora Histokompatibilitetskomplexet (MHC) (de har H2D-haplotypen) och vävnader kan transplanteras mellan stammar, innehåller klass 1B-locus i BALB/cByJ en deletion inQa-2 på kromosom 17 (Mellor, A., et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA 82:5920, 1985). För ytterligare variationer mellan BALB/c substrains upprätthålls över hela världen se BALB/c mus. Genetik och immunologi, M. Potter (Red.), Aktuella ämnen i en mikrobiologi och immunologi 122, Springer-Verlag, 1985.
fenotypiska skillnader: du är inte den stam jag kände förut!
som du kan förvänta dig av två stammar som har odlat separat sedan 1935 har BALB/cJ och BALB/cByJ många fenotypiska skillnader. BALB / cByJ har en högre reproduktiv prestanda och är mindre aggressiv än BALB/cJ. BALB / cByJ-kvinnor är bra mödrar och används ofta som fostermödrar. BALB / cByJ-möss har spontan dystrofisk hjärtkalcinos, förhöjda fria fettsyror, höga triglyceridnivåer och ett antal hematologiska avvikelser. Andra fenotyper mellan dessa stammar jämförs i Musfenomdatabasen.
val av substrains: och vinnaren är…
Nu när du vet att substrains av BALB/c finns, är det beslutstid. I slutändan, att välja vilken BALB / c-substrain som passar bäst för din forskning beror på ett antal faktorer. Om du försöker upprepa eller bygga på tidigare experiment, gör allt för att identifiera och använda samma stam. På så sätt undviker du att införa skillnader i genetisk bakgrund och fenotyp. Att lägga till en ny variabel i din experimentella design är det sista du vill göra. Det är redan svårt att få statistiskt signifikanta resultat! Om du börjar en ny forskningslinje, överväga beteendet, avelsprestandan och dokumenterade genetiska och fenotypiska egenskaper hos de två substrainerna.