w ramach swoich badań przeczytałeś artykuł, który wspomina o myszach BALB / C. Znajdujesz tę mysz w Bazie Danych myszy JAX® i zastanawiasz się, której myszy BALB/c użyli naukowcy – BALB/CJ (000651) lub BALB/CBYJ (001026). Jaka jest różnica (jeśli w ogóle) i którego z nich powinieneś użyć do swoich badań?
Substrains: jak to nie wszystkie są takie same?
zacznijmy od odpowiedzi na to pytanie od krótkiego przejrzenia, czym są podst. Substrain może powstać na kilka sposobów: 1) gdy spontaniczna mutacja zostaje ustalona w Kolonii, a Kolonia ta jest utrzymywana jako oddzielna linia, 2) gdy myszy z tej samej Kolonii macierzystej są utrzymywane oddzielnie przez 20 pokoleń lub więcej. Skupmy się na drugiej drodze. Załóżmy, że otrzymaliśmy myszy BALB / c z tego samego źródła. Jeśli moja Kolonia rozmnaża się od 11 pokoleń, a twoja od 9 pokoleń, nasze dwie kolonie są technicznie podrzędne. Dlaczego? Ponieważ są one oddalone od siebie o 20 pokoleń (11 + 9) i w tym czasie mogły rozwinąć się spontaniczne mutacje powodujące unikalne różnice fenotypowe.
podobnie pierwotny szczep BALB/c rozdzielił się na dwa główne podst. (BALB/CJ i BALB / CBYJ) w 1935 roku. Więcej szczegółów na temat historycznego rozwoju tych dwóch podpunktów można znaleźć w Potter et al. 1985 (History of the BALB/c family, Curr Topics Microbiol Immunol. 122:1-5), the Mouse Genome Informatics website, the Origins of Inbred Mice, and in the Handbook on Genetically Standaryzed Jax Mice. Chociaż są blisko spokrewnione, BALB / CJ i BALB / CBYJ nie są identyczne.
różnice genetyczne sprawiają, że wszystkie różnice
znane różnice genetyczne między tymi dwoma podstrainami obejmują co najmniej trzy mutacje w szczepie BALB / CBYJ: 1) Acadsdel-J (dehydrogenaza acylo-koenzymu A, krótki łańcuch) i 2) ahrb-2 (receptor arylo-węglowodorowy). Chociaż te dwa szczepy są uważane za dopasowane w głównym kompleksie zgodności histologicznej (MHC) (mają haplotyp H2d) i tkanki mogą być przeszczepiane między szczepami, locus klasy 1b w BALB/cByJ zawiera delecję inQa-2 na chromosomie 17 (Mellor, A., et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA 82:5920, 1985). Aby uzyskać dodatkowe różnice między podstrami BALB/c utrzymywanymi na całym świecie, Zobacz Mysz BALB / C. Genetics and Immunology, M. Potter (ed.), Current Topics in a Microbiology and Immunology 122, Springer-Verlag, 1985.
różnice fenotypowe: nie jesteś takim szczepem, jakiego znałam wcześniej!
jak można się spodziewać po dwóch szczepach, które były hodowane oddzielnie od 1935 roku, BALB/CJ i BALB / CBYJ mają liczne różnice fenotypowe. BALB / CBYJ ma wyższą wydajność reprodukcyjną i jest mniej agresywny niż BALB / CJ. Samice BALB/cByJ są dobrymi matkami i są powszechnie używane jako matki zastępcze. U myszy BALB/cbyj występuje samoistna dystroficzna kalcynoza serca, podwyższone stężenie wolnych kwasów tłuszczowych, wysoki poziom trójglicerydów oraz szereg nieprawidłowości hematologicznych. Inne fenotypy pomiędzy tymi szczepami są porównywane w bazie danych Fenomów myszy.
wybór podciągów: a zwycięzcą jest …
teraz, gdy wiesz, że istnieją podciągi BALB/c, nadszedł czas na decyzję. Ostatecznie wybór podciągu BALB/c najlepiej nadaje się do badań zależy od wielu czynników. Jeśli próbujesz powtórzyć lub zbudować na poprzednich eksperymentach, dołożyć wszelkich starań, aby zidentyfikować i użyć tego samego szczepu. W ten sposób unikniesz wprowadzania różnic w tle genetycznym i fenotypie. Dodanie nowej zmiennej do projektu eksperymentalnego jest ostatnią rzeczą, którą chcesz zrobić. Już wystarczająco trudno jest uzyskać statystycznie istotne wyniki! Jeśli rozpoczynasz nową linię badań, rozważ zachowanie, wydajność hodowlaną i udokumentowane cechy genetyczne i fenotypowe obu podpasek.