学習目的
- rグループを使用して汎用官能基を描画する-セクション3.1を参照してください
Generic(abbreviated)Organic Structures
第2章では、有機官能基を認識し、区別することを学びました。 多くの場合、有機構造を描くとき、化学者は、関心領域の外側の分子の一部を指定するために文字’R’を使用することが便利であることがわかります。 「Ｒ」は、「残りの分子」を表す。 たとえば、特定の分子を描画せずに一般的に官能基を参照したい場合は、関心のあるグループに注意を集中するために’Rグループ’を使用できます。
‘R’グループは、特に分子上のある場所で特異的に発生しているものに興味があるときに、大きな生物学的分子の構造を省略する便利な方法です。 例えば、第15章では、フラビン分子を含む生化学的酸化還元反応を見るとき、関心のある反応では全く変化しないフラビン構造の大部分を省略します。
代替として、”break”記号を使用して、より大きな分子の小さな部分またはセクションを見ていることを示すことができます。 これは蛋白質またはDNAのような大きいポリマーのデッサンのグループの文脈で一般に使用されます。 p>
最後に、’R’グループは、ペニシリン系抗生物質のファミリーのような一連の関連化合物を簡潔に示すために使用することができます。
略語を適切に使用することは、多くの生体分子が非常に大きく複雑である（そして描くために永遠にかかる）ため、生物学的な文脈で有機化学を勉強するときに開発するための非常に重要なスキルです！）、通常、我々は変化が起こっている分子のほんの一部に焦点を当てています。
原則として、説明されている結合破壊または結合形成イベントに関与する原子を省略してはいけません。 例えば、以下の反応物/生成物中の炭素＃2は、最も確実に結合変化に関与しているため、’R’基に含まれるべきではありません。
例えば、以下の反応物/生成物中の炭素＃2は、結合変化に関与している。
構造体の一部を描画するか省略するかわからない場合は、最も安全なことはそれを描画することです。
練習
1. a)コカインのメチルエステル官能基(前の図を参照)がカルボキシレートとメタノールに変換された反応の化学的詳細を引き出す場合、コカイン構造に使用する適切な略語は何でしょうか(エステル基で特異的に発生する化学的性質についてのみ議論したいと仮定します)。b）以下は、植物が二酸化炭素を「固定」する「Rubisco」として知られる酵素によって触媒される（やや複雑な）反応である。
b）以下は、植物が二酸化炭素を「固定」す 二酸化炭素と水の酸素は、それらの原子が製品に組み込まれている場所を見るのを助けるために、それぞれ赤と青に着色されています。 二つの異なる”R”基、R1およびR2を使用して、出発化合物（リブロース1,5-ビスリン酸）の適切な略語を提案する。 p>
演習の解決策