A szigetek a Fülöp-szigetek szervezett a három különálló sziget csoportok szerint régiók: Luzon áll Régiók-V., AUTÓ, NCR; Visayas áll Régiók VI., VIII.; valamint Mindanao áll Régiók IX., XIII., valamint BARMM. Ha egy tartományt áthelyeznek egy új régióba, akkor azt áthelyezhetik egy új szigetcsoportba is, mint Palawan esetében, amikor ideiglenesen Mimaropáról Nyugat-Visayasba rendelték, így ideiglenesen a Visayas részét képezték.
maguk a szigetcsoportok nem saját kormányokkal rendelkeznek, hanem tartományokra, városokra, településekre és barangayokra oszlanak, amelyeknek saját önkormányzatuk van. A sziget csoportok használják statisztikai kényelem, valamint egyes esetekben a nemzeti kormányzati szervek, hogy a létrehozott pozíciók, amelyek lefedik a sziget csoportok, mint például a Helyettes Államtitkár, a Regionális Műveletek Mindanao a Minisztérium közérdekű Munkálatok, Autópályák (DPWH), illetve a Helyettes Államtitkár a Luzon Ügyek a Szociális Jóléti Minisztérium Fejlesztés (DSWD).
bár a szigetcsoportoknak nincsenek önkormányzataik, így fővárosaik, egyes városok a szigetcsoportok politikai, gazdasági és kulturális központjává váltak. Manila a nemzeti főváros, de facto Luzon fővárosa, bár a szomszédos Quezon város, egy korábbi főváros, több lakosa van, mint Manila. Cebu, az azonos nevű tartományban és szigeten, a Visayák fővárosa. Mindanao fő városa Davao, délkelet felé.