a kutatás részeként olvas egy cikket, amely megemlíti a BALB / C egereket. Lenyomozod az egeret a Jax ® Egerek adatbázisában, és kíváncsi vagy, hogy melyik BALB/C egeret használták a kutatók-BALB / cJ (000651) vagy BALB/cByJ (001026). Mi a különbség (ha van ilyen), és melyiket kell használni a kutatáshoz?
Substrains: hogy érted, hogy nem mind egyformák?
kezdjük megválaszolni ezt a kérdést röviden áttekintve, hogy mi az alállomások. Az alállomás néhány módon felmerülhet: 1) amikor egy spontán mutáció rögzül egy kolóniában, és ezt a kolóniát külön vonalként tartják fenn, 2) amikor ugyanazon szülő kolóniából származó egereket 20 vagy több generáción keresztül külön tartják fenn. Összpontosítsunk a második útra. Tegyük fel, hogy ugyanabból a forrásból szereztük be a BALB/C egereket. Ha az én kolóniám 11 generáció óta tenyészik, a tied pedig kilenc generáció óta, a mi két kolóniánk technikailag nem állja meg a helyét egymásnak. Miért? Mivel 20 generáció (11 + 9) egymástól, és ez idő alatt spontán mutációk alakulhattak ki, amelyek egyedi fenotípusos különbségeket eredményeztek.
Hasonlóképpen, az eredeti BALB/c törzs két fő alállomásra (BALB/cJ és BALB/cByJ) oszlott 1935-ben. További részletek a történelmi fejlődés e két alállomások megtalálható Potter et al. 1985 (a BALB/C család története, Curr témák Mikrobiol Immunol. 122:1-5), az Egérgenom informatikai weboldala, a beltenyésztett Egerek eredete, valamint a genetikailag szabványosított Jax Egerek kézikönyve. Bár szorosan összefügg, a BALB / cJ és a BALB / cByJ nem azonosak.
genetikai különbségek teszik a különbséget
a két altrain között ismert genetikai különbségek legalább három mutációt tartalmaznak a BALB / cByJ törzsben: 1) Acadsdel-J (Acil-koenzim A dehidrogenáz, rövid lánc) és 2) Ahrb-2 (aril-szénhidrogén receptor). Bár ez a két törzs a fő hisztokompatibilitási komplexben (MHC) párosnak tekinthető (H2d haplotípussal rendelkeznek), és a szövetek átültethetők a törzsek között, a balb/cByJ 1b osztályú locus a 17.kromoszómán (Mellor, A., et al., Proc. NAT. Acad. Sci., USA 82:5920, 1985). Az egész világon fenntartott BALB/c alállomások közötti további variációkhoz lásd a BALB / C egeret. Genetika és Immunológia, M. Potter (Szerk.), A mikrobiológia és Immunológia aktuális témái 122, Springer-Verlag, 1985.
fenotípusos különbségek: nem te vagy az a törzs, akit korábban ismertem!
amint az 1935 óta külön tenyésztett két törzsből várható, a BALB / cJ és a BALB / cByJ számos fenotípusos különbséggel rendelkezik. A BALB / cByJ nagyobb reprodukciós teljesítményt nyújt, és kevésbé agresszív, mint a BALB / cJ. A BALB / cByJ nőstények jó anyák, gyakran használják nevelőanyákként. BALB / cByJ egerek spontán dystrophiás szív kalcinózis, emelkedett szabad zsírsavak, magas triglicerid szint, és számos hematológiai rendellenességek. A törzsek közötti Egyéb fenotípusokat az egér fenomén adatbázisában hasonlítják össze.
alállomások kiválasztása: és a győztes …
most, hogy tudod, hogy a BALB/c alállomások léteznek, itt a döntés ideje. Végső soron annak kiválasztása, hogy melyik BALB / c alállomás a legmegfelelőbb a kutatáshoz, számos tényezőtől függ. Ha megpróbálja megismételni, vagy építeni a korábbi kísérletek, mindent megtesz annak érdekében, hogy azonosítsa és használja ugyanazt a törzs. Így elkerülheti a genetikai háttér és a fenotípus közötti különbségeket. Új változó hozzáadása a kísérleti tervezéshez az utolsó dolog, amit meg akar tenni. Már elég nehéz statisztikailag szignifikáns eredményeket elérni! Ha új kutatási vonalat kezd, fontolja meg a két alállomás viselkedését, tenyésztési teljesítményét és dokumentált genetikai és fenotípusos jellemzőit.