luonnollinen esiintyminen
monet organohalogeeniyhdisteet, joissa halogeeni on suoraan kiinnittynyt bentsenoidirenkaaseen, esiintyvät luonnollisesti. Toisin kuin alkyyli-ja vinyylihalideissa, joista merellinen alkuperä on yleisin, aryylihalideissa esiintyy useita eri lähteitä. esimerkiksi L-tyroksiini on kilpirauhasen erittämä jodia sisältävä aminohappo, joka toimii aineenvaihdunnan säätelijänä. Aikoinaan eläinten tyreideistä uutettua luonnollista l-tyroksiinia käytettiin tyroksiinipuutteiden hoitoon, mutta nykyään lähes kaikki kilpirauhasen häiriöiden hoitoon käytetty l-tyroksiini on synteettistä.
yksinäisen tähtipunkin, Amblyomma americanumin, sukupuoliferomoni on 2,6-dikloorifenolia, ja 2,6-dibromifenolia on eristetty tammenterhomadosta, Balanoglossus biminiensis.
useat halogeenipitoiset aromaattiset yhdisteet, jotka eivät ole luonnontuotteita sanan tavanomaisessa merkityksessä, ovat levinneet ympäristöön laajalti. Tutuin esimerkki on 1,1,1-trikloori-2,2-bis(p-kloorifenyyli)etaani eli DDT.
DDT otettiin käyttöön 1940-luvun alussa, ja siitä tuli pian sekä maatalouden valitsema hyönteismyrkky että pääasiallinen keino torjua tauteja kantavia hyönteisiä. Yksi DDT: n eduista on, että se on pysyvä hyönteismyrkky, mikä tarkoittaa, että se hajoaa hitaasti luonnollisilla prosesseilla ja säilyy pitkään alkuperäisen levityksen jälkeen. DDT osoittautui niin tehokkaaksi viljasatojen kasvattamisessa ja hyönteisten levittämien tautien, kuten malarian, hillitsemisessä, että hyönteismyrkyn kehittänyt sveitsiläinen kemisti Paul Müller sai Nobelin fysiologian tai lääketieteen palkinnon vuonna 1948. 1960-luvulla tehdyt tutkimukset kuitenkin paljastivat, että DDT: tä kertyi kalojen, lintujen ja muiden eläinten rasvakudokseen ja että DDT-pitoisuudet lisääntyivät siirryttäessä ravintoketjussa ylöspäin. Lintujen korkeisiin DDT-pitoisuuksiin liittyi hauraita munankuoria ja lisääntymishäiriöitä. Mahdolliset haitat villieläimille ja ihmisille sekä se, että monet hyönteiset olivat tulleet vastustuskykyisiksi DDT: lle, saivat Yhdysvaltain ympäristönsuojeluviraston EPA: n kieltämään sen käytön lähes kokonaan vuonna 1972.
toinen klooripitoinen aromaattinen yhdiste, joka on laajalle levinnyt ympäristössä, on 2,3,7,8-tetraklooridibentso-p-dioksiini (tunnetaan yksinkertaisesti nimellä dioksiini).
dioksiinia muodostuu pieniä määriä sivutuotteena rikkakasvien torjunta-aineen 2,4,5-trikloorifenoksietikkahapon (2,4,5-T) synteesissä, klooripohjaisissa valkaisuprosesseissa paperintuotannon aikana ja aina, kun orgaaninen materiaali palaa kloridi-ionin lähteen läsnä ollessa, kuten esimerkiksi metsäpaloissa. Se on hyvin stabiili yhdiste ja kertyy vähitellen ympäristöön. Koska dioksiini on koe-eläimille erittäin myrkyllistä, karsinogeenista ja teratogeenista, on pantu täytäntöön säännöksiä, joiden tarkoituksena on rajoittaa ympäristön saastumista entisestään.
aryylihalideja, joita kutsutaan polyklooratuiksi Bifenyyleiksi (PCB), valmistettiin aiemmin suuressa mittakaavassa käytettäväksi lämmönsiirtovälineinä ja eristemateriaaleina muuntajissa ja muissa sähkölaitteissa. Monet DDT: hen ja dioksiiniin ympäristösaasteina liittyvät ongelmat koskevat myös PCB: tä, ja EPA kielsi PCB: n tuotannon vuonna 1979.