antiikin kreikkalaisille Välimerta kutsuttiin nimellä Thetis, valtameren vaimo ja meren hedelmällisyyden symboli ja kaikkien jokien Äiti, siksi geologit nimittivät Thetistä Välimeren ensimmäisen muodostuman.
mannerlaatat, jotka vielä nykyäänkin liikuttavat maankuorta, aiheuttivat mannerten irtoamisen. Se ei ollut nopea ilmiö, se kesti monta vuotta ja se aiheutti merenpinnan heilahteluja, jotka toivat meriveden nykyiseen Saksaan. Tuloksena oli meri, jota nykyään kutsumme Välimereksi, ja se jakautuu kahteen altaaseen, länteen ja itään. Välimeri on meri, jonka nimet vastaavat kaikkia siihen kuuluvia meriä: Alboranmeri, Baleaarinmeri, Ligurianmeri, Algerianmeri, Tyrrhenanmeri, Joonianmeri, Adrianmeri, Egeanmeri, Levantiinmeri, Marmaranmeri, Mustameri.
suurin Välimerestä löytyvä syvyys on 4 384 metriä, joka vastaa Levantinmerta Gretan saaren, Turkin ja Egyptin välissä. On pidettävä mielessä, että koko maailman syvin tunnettu kohta sijaitsee Tyynellämerellä, aivan Mariaanien saarilla, missä syvyys on 10 900 metriä. Välimeri on lähes suljettu meri, sillä on vain kohta, jossa vesi tulee ja lähtee ja tämä kohta on Gibraltarinsalmi. Salmi syntyi luonnollisesti maankuoren liikkeiden ansiosta toisin kuin ihmisen luomat Suezin tai Bosporinsalmen kanavat. Gibraltarinsalmi on vain 300 metriä syvä, ja tästä syystä Välimeri ei saa paljon vettä Atlantin valtamerestä, ja se kärsii suuremmasta suolapitoisuudesta, jota korostaa myös korkea haihtuminen, joka kärsii kuumimpien vuodenaikojen kuukausina.
Välimerellä on edustettuna kolme eri kategoriaa: Plankton, Nekton ja Benthos. Plankton on ryhmä kasveja ja eläimiä, jotka elävät kelluen merivirtojen, kuten esimerkiksi meduusat. Suurin osa planktonista on mikroskooppista. Uivat eliöt pienistä selkärangattomista kaloihin muodostavat Nektonin, ja esimerkkejä tästä ovat seepia ja lohi. Benthoksiin kuuluvat liikkumattomat tai osittain liikkumattomat eläimet ja meren syvyyksissä elävät kasvit, kuten Posidonia-levät.
Välimeren yleisimpiä kaloja ovat rannikkovesissä elävä lahna; kultapääahna, joka elää matalissa vesissä sekä kallio-että hiekkasyvyyksissä; Punaisenmeren lahna, joka on yleinen merieläinkala, jota löytyy Euroopan rannoilta; ainoa kala, joka kuuluu yhteen nykyisistä kampelakalalajeista; meriahven, kala, jota löytyy sekä Välimerestä että Atlantin valtamerestä; Välimeren sateenkaarikrassi, joka elää kivisillä pohjilla lähellä Posidonia; Itä-Atlantin riikinkukkokrassi, joka elää myös lähellä Posidonia-niittyjä; John Dory elää lähellä hiekka – tai savisyvyyksiä; sardiinit, kala, joka elää pankit 10 metrin syvyydestä ja lopuksi castanet, kala, joka löytyy helposti lähellä kiviä ja Posidonia etäisyydellä 4 tai 5 metriä syvyydestä.