Joulukuuta. 2, 1825, Pedro syntyi keisarillinen Residenssi São Christovão. Kun hänen isänsä Pedro I luopui kruunusta vuonna 1831, nuoresta Pedrosta tuli kirjaimellisesti kansakunnan holhooja. Hänen koulutus, niin jäykästi jäsennelty, että lähes kaikki hänen valveillaoloaika oli käytetty tutkimus, valmis häntä hyvin hänen tulevia tehtäviä.
Pedron 18-vuotiaaksi asti Brasiliaa piti hallita sijaishallitsija, mutta 9-vuotisen interregnumin aikana valtakunta lähes hajosi. Tunnustaen sijaishallitsijan täydellisen epäonnistumisen liberaalit pakottivat julistamaan Pedron enemmistön 23. heinäkuuta 1840. Vuonna 1843 hän meni naimisiin Napolin prinsessa Thereza Christinan kanssa. Vuonna 1850 järjestys palautettiin ja monarkia siirtyi sisäisen vakauden aikakaudelle. Ensi silmäyksellä Pedro II: n hallitus muistutti Britannian parlamentaarista järjestelmää, mutta todellisuudessa keisari oli valtiomestari. Hän käytti järkevästi poder moderadoria (maltillista valtaa) ja loi poliittisen tasapainon, joka takasi kotirauhan suurimman osan hänen 49-vuotisesta valtakaudestaan.
Pedro joutui yli 2 vuosikymmenen ajan kamppailemaan Britannian taloudellisen ja poliittisen johtoaseman kanssa-perintönä vanhalta Portugalin keisarikunnalta. Hän joutui suureen kriisiin Britannian parlamentin hyväksyttyä Aberdeenin lain vuonna 1845, kun brittialukset tunkeutuivat mielivaltaisesti Brasilian satamiin ja katkaisivat afrikkalaista orjakauppaa harjoittavat alukset. Joulukuussa 1862 Britannia saarsi Rion väliaikaisesti englantilaisten merimiesten ja brasilialaisten virkamiesten välisten kiistojen jälkeen.
Pedro II: n interventio ryhmittymien repimässä Uruguayssa soti Brasilian kanssa Argentiinan Juan Manuel de Rosasia vastaan vuosina 1851-1852. Uruguayssa vallitsi kaoottinen tilanne 1860-luvulle asti, ja syyskuussa 1864 Pedro lähetti keisarillisia joukkoja Brasilian kansalaisiin kohdistuneiden hyökkäysten seurauksena. Paraguayn diktaattori Francisco Solano López hyökkäsi Mato Grosson alueelle joulukuussa. Brasilia liittyi Argentiinan ja Uruguayn kanssa Kolmoisliiton sotaan toukokuussa 1865, mutta joutui kärsimään pahimman mahdollisen taistelun Pedron kieltäytyessä kompromissista tai sovittelusta, kunnes López eliminoitaisiin. Viisi vuotta kestänyt konflikti oli Brasilialle kallis: se tyhjensi valtion kassan, maksoi 50 000 ihmishenkeä ja lykkäsi monia kiireellisiä sisäisiä uudistuksia. Sodan jälkeen useiden tekijöiden yhteenotto oli omiaan tuhoamaan Braganza-dynastian. Vaikka Pedro oli edelleen ylivoimaisen suosittu, monarkia ei ollut. Hän rohkaisi vuonna 1870 perustettua tasavaltalaista puoluetta, ja republikaaniset ajatukset levisivät laajalti lehdistössä, jonka vapautta hän tarkasti varjeli.
Brasilia koki 1870-luvulla ensimmäisen vakavan kirkon ja valtion välisen konfliktinsa. Olindan ja Parán piispat, vastoin Pedron, entisen Vapaamuurarillisen suurmestarin, määräyksiä, jatkoivat irmandadesin (maallikkoveljeskuntien) moittimista piireissään, jotka kieltäytyivät hylkäämästä Vapaamuurariutta. Kun piispat uhmasivat itsepintaisesti siviilivaltaa, heidät pidätettiin ja tuomittiin 4 vuodeksi pakkotyöhön alkuvuodesta 1874. Pedro helpotti tilannetta syyskuussa 1875 myöntämällä armahduksen, mutta oli jo menettänyt papiston tuen.
orjuuskysymys heikensi myös keisarin asemaa. Vaikka hän oli kiihkeä abolitionisti, hän ajautui vapautukseen tajutessaan, että orjia omistava fazendeiros oli hänen vahvin tukensa. Maaliskuussa 1888 julistettu täydellinen, korvaukseton lakkauttaminen kuitenkin vieraannutti plantaasit.
merkittävä tekijä monarkian kukistumisessa oli kuitenkin militarismin nousu. Paraguayn sodan jälkeen armeija kehittyi positivismin innoittamana ylimieliseksi Piittaamattomuudeksi siviilijohtoa kohtaan. Vakava sairaus vuonna 1887 heikensi suuresti Pedron fyysistä ja henkistä kykyä, ja hänen toimettomuutensa armeijan vallankaappauksen aikana marraskuussa. 15, 1889, tuhonnut valtakunnan. Marraskuuta tasavalta julistettiin ja seuraavana päivänä kuningasperhe karkotettiin maasta. Pedro kuoli Pariisissa joulukuussa. 5, 1891.