yhtiö sai alkunsa The Daily Bee-lehdestä, joka julkaistiin alun perin Sacramentossa Kaliforniassa 3.helmikuuta 1857 Alkuperäisamerikkalaisen kirjailijan Rollin Ridgen kustantamana. James McClatchy liittyi Ridgen työpariksi ja otti päätoimittajan paikan. Tunnettu kansan etujen kannattajana yrityksiä ja korruptoituneita poliitikkoja vastaan, McClatchy teki Mehiläisestä edistyksellisen reformismin linnakkeen. Mcclatchyn kuoltua vuonna 1883 lehden johto siirtyi Jamesin pojalle Charles Kenny Mcclatchylle, joka veljensä Valentine Stuartin kanssa osti Ridgen perheen edut. Kaksikko modernisoi lehteä perustamalla Mcclatchyn Sanomalehtiä perustamalla Fresno been vuonna 1922 ja hankkimalla Modesto been vuonna 1924. C. K. Mcclatchyn perintöä alueelle on muistettu Sacramentossa sijaitsevassa C. K. McClatchy High Schoolissa, joka avattiin vuonna 1937, noin vuosi hänen kuolemansa jälkeen.
suurimman osan historiastaan yhtiö keskittyi sanomalehtiliiketoimintaan Kalifornian Sacramento Valleyssa ja San Joaquin Valleyssa. Vuonna 1978 Charles K. McClatchy otti yhtiön haltuunsa ja ohjasi mediayhtiötä kohti nykyaikaista julkisesti omistettua The McClatchy Companya hankkimalla lisää valtion ulkopuolisia sanomalehtiä, Anchorage Daily Newsiä Anchoragessa Alaskassa ja Tri-City heraldia Kennewickissä Washingtonissa.
McClatchy osti myös silloisen ABC: n tytäryhtiön KOVRIN Metromedialta vuonna 1965. Yhtiön oma Modesto Bee ilmoitti aseman myynnistä. Se myytiin Outlet-yhtiölle vuonna 1978, ja nykyään se on CBS: n omistuksessa oleva asema.
vuonna 1990 McClatchy hankki kolme päiväpaikkaa Etelä-Carolinasta: Herald Rock Hillissä, Island Packet Hilton Headissa ja Beaufort Gazette of beaufortissa. Vuonna 1995 se osti Newsin & Observer of Raleigh, North Carolina, ja vuonna 1998 se osti Minneapolisilaisen Star Tribunen.
tammikuussa 2004 McClatchy osti Merced Sun-Star of Mercedin ja viisi siihen kuuluvaa ei-päiväliikettä Kalifornian San Joaquin Valleyssa.
yhtiön suurin yrityskauppa tapahtui 27.kesäkuuta 2006, kun McClatchy osti Knight Ridderin. Koska McClatchy oli tuolloin niin paljon pienempi kuin Knight Ridder, eräs tarkkailija rinnasti sopimuksen ” delfiiniksi, joka nieli pienen valaan.”Mcclatchyn A-luokan osakkeiden 40 dollarin ja 0,5118 osakkeen kauppahinta osaketta kohden oli yhteensä noin 4 miljardia dollaria käteisenä ja osakkeina. Yhtiö otti myös 2 miljardin dollarin velat. Tämä osto lisäsi 20 sanomalehtiä yhtiön vakaa ja välitön myynti (seuraavien viiden viikon aikana) 12 julkaisuja kuten St. Paul Pioneer Press, San Jose Mercury News ja Philadelphia Inquirer. Nämä myynnit saatiin päätökseen 2. elokuuta 2006. Tämä hankinta mainittaisiin suurimpana syynä Mcclatchyn myöhempiin ongelmiin-McClatchy maksoi Knight Ridderille liikaa ostamalla ”markkinoiden huipulta”, ja valtava velka, joka otettiin oston polttoaineeksi, olisi myllynkivi yhdistetyn yhtiön kaulassa. Lisäksi McClatchy ei pitänyt yhtään Knight Ridderin digitaalista osastoa tai yrityksen henkilökuntaa, vaikka Internet oli yhä näkyvämpi ja Knight Ridderillä oli siihen aikaan arvostettu yritys tilassa.
Minneapolis-St. Vuonna 1998 ostetulla ja vuonna 2007 pääomasijoitusyhtiö Avista Capital Partnersille 555 miljoonalla dollarilla myydyllä Paul Star Tribunella oli kaikista Mcclatchyn sanomalehdistä suurin levikki.
yhtiö omistaa myös salkun digitaalisia omaisuuseriä, mukaan lukien 15,0% CareerBuilder, LLC: stä, joka toimii CareerBuilder.com; 25.6% turvaluokiteltujen Ventures, LLC, yritys, joka tarjoaa turvaluokiteltuja sivustoja, kuten auto website Cars.com; ja 33,3% HomeFinder, LLC: stä, joka ylläpitää online-kiinteistösivustoa HomeFinder.com. McClatchy omistaa myös 49,5% äänioikeutetuista osakkeista ja 70.6% Seattle Times Companyn äänioikeuttamattomasta osakekannasta.
tammikuussa 2017 entinen Yahoo! Earthlinkin toimitusjohtaja Craig Forman nimitettiin sen uudeksi toimitusjohtajaksi (CEO). Yksityinen sijoittaja ja Mcclatchyn hallituksen jäsen Forman seurasi tehtävässä Patrick Talamantesia, joka toimi toimitusjohtajana neljä edellistä vuotta.
C. K. Mcclatchyn jälkeläiset omistavat edelleen määräysvallan McClatchy-yhtiössä ja heitä edustaa 6.sukupolven Kevin McClatchy hallituksen puheenjohtajana.
helmikuussa 2019 Forman viestitti koko henkilökunnalle, että noin 10 prosentille lehtiketjun työntekijöistä tarjottaisiin vapaaehtoisia yritysostoja.
Helmikuuta 2020 McClatchy haki Chapter 11-konkurssisuojaa. Yhtiö mainitsi hakemuksen tärkeimpinä syinä Eläkevelvoitteet ja liiallisen velan.
McClatchy Company ja 54 osakkuusyhtiötä hakivat Chapter 11: n konkurssiin Yhdysvaltain piirioikeudessa New Yorkin eteläisessä piirikunnassa.