perinteisesti lahko kädelliset jaettiin Prosimii-lahkoon (alkukantaiset kädelliset: puoliapinat, lorit ja tarsierit) ja Anthropoidea-lahkoon (isoaivoiset apinat ja apinat, myös ihmiset). Nykyisin tiedetään, että yksi” prosimeista”, tarsier, on itse asiassa läheisempää sukua” antropoideille”, joten kädellisten luokittelua on jouduttu tarkistamaan. Nykyisin tunnistettavat kaksi alalahkoa ovat Strepsirrhini (makit ja lorit) ja Haplorhini (tarsijat, apinat ja apinat, myös ihmiset). Nykyinen luokittelu otettiin käyttöön 1970-luvun alussa, jolloin fylogeneettisen systematiikan logiikkaa alettiin arvostaa, ja lahkon kädellisten taksonomia organisoitiin uudelleen niin, että taksonit vastaisivat mahdollisuuksien mukaan kladeja. Tässä luokittelussa järjestys jaetaan alaluokkiin Strepsirrhini ja Haplorhini, ja nämä puolestaan jaetaan infraordereihin.
kaksi alalahkoa eroavat toisistaan muun muassa nenän, silmien ja istukan osalta. Strepsirrhiinien kuono on kostea ja paljas, kuten koiraalla; haplorrhiinien kuono on untuvaisen karvoituksen peittämä. Strepsirrhiineillä on verkkokalvon takana heijastava kerros, tapetum lucidum, joka lisää valon määrää pimeänäköä varten, kun taas haplorrhiineilla ei ole tapetumia vaan sen sijaan tehostetun näön alue, fovea. Tämä ero on johdonmukainen, vaikka kaikki strepsirrhiinit eivät ole yöllisiä tai kaikki haplorrhiinit vuorokautisia. Lopuksi, kohdun seinämä haplorrhin kehitetään ja vaskulisoidaan joka kuukausi mahdollista raskautta varten, muodostaen hemochorial istukka (intiimi kosketus äidin ja sikiön veren virtaukset), jos raskaus tapahtuu ja vaativat sitä irtoa, kuukautiset, jos ei ole hedelmöitystä. Strepsirrhiineillä ei ole kohdun valmistusta, ei kuukautisia ja paljon vähemmän intiimi epiteliochoricial istukka. Kaikki viittaa siihen, että nämä kaksi alalahkoa erkanivat toisistaan hyvin varhain, ehkä 60 miljoonaa vuotta sitten. Strepsirrhinit jakautuvat edelleen Puoliapinoihin (lemuriformes) ja Lorisiformes (lorislike) infraordereihin, kun taas Haplorhinit jakautuvat Tarsiiformesiin (tarsiers) ja Simiiformesiin (”anthropoids”) eli apinoihin, apinoihin ja ihmisiin. Simiiformes jakautuu vuorostaan Platyrrhineihin (uuden maailman apinat) ja Catarrhineihin (vanhan maailman apinat ja hominoidit). Paromomyiformes-niminen fossiilisten nisäkkäiden ryhmä, joka tunnetaan pääasiassa Paleoseenilta, on yleensä luokiteltu kädellisiksi, mutta huomattava kädellisten asiantuntija Robert D. Martin on pitkään väittänyt, että niiden yhteys todennettuihin kädellisiin on vähintäänkin hatara, ja 1990-luvulla paleontologi K. C. Beard löysi käsiluita ja muuta materiaalia, jotka viittaavat vahvasti siihen, että jotkin näistä fossiileista eivät todellisuudessa kuulukaan kädellisille vaan lahkoon Dermoptera.
kädellisten suhteista muihin nisäkkäisiin on keskusteltu paljon. 1930—luvulla ehdotettiin, että tähän asti Insectivora-lahkoon luokitellut pienet kaakkoisaasialaiset Nisäkkäät (tupaiidae) kuuluvat kädellisten lahkoon-tai ainakin että ne ovat läheistä sukua toisilleen. Tämä on osoittautunut vääräksi; Martin on osoittanut yksityiskohtaisesti, miten ne eroavat kädellisistä ja miten virhe syntyi. Kuusenkerkät on nykyään sijoitettu omaan järjestykseensä, Scandentiaan. 1980-luvulla nisäkästutkija Jack Pettigrew havaitsi, että Megachiroptera, lepakoiden alalahko (lahko Chiroptera), joka sisältää hedelmälepakot tai ”lentävät ketut” (heimo Pteropodidae), jakaa näköjärjestelmän piirteitä kädellisten kanssa, ja hän ehdotti, että ne ovat itse asiassa lentäviä kädellisiä, jotka ovat kehittyneet itsenäisesti muista lepakoista (suborder Microchiroptera, kaikuluotaavat, enimmäkseen hyönteisiä syövät pienemmät lepakot). Myöhemmin hän havaitsi, että kolugoilla, niin sanotuilla ”lentävillä puoliapinoilla” (Dermoptera-lahkon ainoilla elävillä edustajilla), on samat piirteet Kaakkois-Aasian sademetsissä. Molekyylitiedot kuitenkin vahvistavat, että siinä missä kädelliset ja kolugot todella ovat läheistä sukua toisilleen, lepakot muodostavat monofyleettisen ryhmän. Siksi joko kädellisillä, kolugoilla ja kaikilla lepakoilla oli yhteinen esi-isä niiden näköjärjestelmän erikoisalojen kanssa, jotka Mikrochiroptera sitten menetti, tai sitten nämä ominaisuudet kehittivät itsenäisesti 1) kädelliset ja colugot ja 2) Megachiroptera. Molekyylitiedot ovat epäselviä sen suhteen, ovatko lepakot kädellisten ja kolugojen sisarryhmä, joten näitä kahta keskenään kilpailevaa hypoteesia ei voida vielä testata.
kuten mikä tahansa luokittelu, tämäkin järjestely on pohjimmiltaan hypoteesi yläheimojen, sukujen ja sukujen välisistä suhteista, ja sitä testataan jatkuvasti löytämällä uusia fossiileja, analysoimalla uudelleen tavanomaisista lähteistä saatuja tietoja ja analysoimalla uusia tietoja, kuten DNA-sekvenssejä. Uusi tietolähde on ollut molekyylikello; Morris Goodman, molekyylibiologi, joka jo vuonna 1963 (ennen kladistista vallankumousta) vaati, että taksonomian pitäisi heijastaa fylogeniaa, ehdotti äskettäin, että sama taksonominen arvo pyrittäisiin antamaan saman aikasyvyyden omaaville ryhmille (mikä vähentää korkeampien kategorioiden subjektiivisuutta), ja hänen ajatuksensa on alkanut saada jalansijaa joillakin tahoilla. R. D. Martinin ja K. C. Beardin esittämien väitteiden mukaisesti (pääasiassa Paleoseenisia) Plesiadapiformeja (tai Paromomyiformeja) ei tässä katsota Kädellisiksi.
- lahko kädellisiä on noin 300 lajia, joita esiintyy pääasiassa trooppisilla alueilla, erityisesti metsissä. Myöhäinen Paleoseeni nykypäivään.
- suborder Strepsirrhini 3 infraorderia 6 perheestä. Tähän sisältyvät 4 fossiiliheimoa ovat varhaisimmat tunnetut kädelliset fossiiliheimossa Petrolemuridae, eoseeniheimot Adapidae ja Notharctidae sekä Eoseenista Keski-Mioseeniheimoon sivaladapidae.
- Infraorder Chiromyiformes 1-suku.
- heimo Daubentoniidae (aye-ayes) 1 suku, 2 lajia, yksi äskettäin sukupuuttoon kuollut, ehkä viimeisen 500 vuoden aikana, Madagaskarilta. Holoseeni.
- Infraorder Lemuriformes (puoliapinat)
- heimo Cheirogaleidae (kääpiömakit, Hiiret ja haarukkamakit) 5 sukua, vähintään 25 lajia Madagaskarilta. Lajien lukumäärää ei voida tarkasti kertoa, sillä uusia lajeja löydetään jatkuvasti. Holoseeni.
- alaheimo Cheirogaleinae (kääpiö-ja hiirimakit)
- alaheimo Phanerinae (haarukkamakit)
- heimo puoliapinat (”oikeat” puoliapinat) 5 sukua, noin 18 lajia Madagaskarilta. 1 Holoseenifossiili suku.
- heimo Megaladapidae (sportive ja koala makit) 1 suku, ainakin 10 lajia Madagaskarilta. 1 Holoseenifossiili suku.
- heimo Indridae (indris, sifakas ja avahis) 3 sukua ja noin 14 lajia Madagaskarilta. Holoseeni.
- heimo Palaeopropithecidae (laiskiaismakit) 4 sukua ja 5 lajia Madagaskarilta, kaikki kuolleet sukupuuttoon viimeisen 2 000 vuoden aikana. Holoseeni.
- heimo Archaeolemuridae (paviaanimakit) 2 äskettäin sukupuuttoon kuollutta sukua ja 3 lajia Madagaskarilta, kaikki sukupuuttoon viimeisen 2 000 vuoden aikana. Holoseeni.
- heimo Cheirogaleidae (kääpiömakit, Hiiret ja haarukkamakit) 5 sukua, vähintään 25 lajia Madagaskarilta. Lajien lukumäärää ei voida tarkasti kertoa, sillä uusia lajeja löydetään jatkuvasti. Holoseeni.
- Infraorder Lorisiformes 2 perhettä.
- heimo Lorisidae vähintään 4 sukua, vähintään 11 lajia Afrikasta ja Aasiasta. 1 fossiilinen suku. Mioseeni.
- alaheimo Lorisinae (lorises) 2 sukua, noin 8 kaakkoisaasialaista lajia.
- alaheimo Perodicticinae (pottos ja angwantibos) 2 tai useampi suku, 3 tai useampi laji Afrikasta.
- heimo Galagidae (pensasvauvat eli galagot) 4 sukua, joissa on noin 20 afrikkalaista lajia. 3 fossiiliset suvut. Mioseeni Holoseenille.
- heimo Lorisidae vähintään 4 sukua, vähintään 11 lajia Afrikasta ja Aasiasta. 1 fossiilinen suku. Mioseeni.
- Suborder Haplorhini 2 infraorderia 9 elävästä suvusta, joissa on 41 elävää sukua; 8 fossiiliperheessä on noin 50 eoseenilta peräisin olevaa fossiilisukua.
- Infraorder Tarsiiformes 1 elävä heimo; tähän luetaan Eoseenista varhaisiin Mioseeniheimoihin Anaptomorphidae ja Omomyidae.
- heimo Tarsiidae (tarsiers) 1 suku, noin 7 aasialaista lajia. 2 fossiililajia Keskiseltä Eoseenilta Holoseenille.
- Infraorder Simiiformes 8 elävää ja 6 Fossiilisukua ajoitetaan varhaiselle Mioseenille.
- Platyrrhini (uuden maailman apinat) 5 elävää sukua, joissa on yli 93 lajia. 1 fossiiliheimo 7 myöhäisestä Oligoseenista varhaiseen Mioseenisukuun (8 lajia) ei ole luokiteltavissa mihinkään näistä suvuista.
- heimo Callitrichidae (marmosetit) 4 sukua, vähintään 27 lajia Etelä-ja Keski-Amerikassa. 3 fossiilisia lajeja 3 sukupuuttoon suvut dating varhaisesta Mioseeni Holoseeni.
- heimo Cebidae (kapusiinit ja oravaiset) 2 sukua, noin 10 lajia. Etelä-ja Keski-Amerikassa.
- heimo Aotidae (durukulit eli yöapinat) 1 suku, 9 lajia. Etelä-ja Keski-Amerikassa.
- heimo Pitheciidae (sakis, uakaris ja titis) 4 sukua, vähintään 29 eteläamerikkalaista lajia. 3 fossiililajia 2 suvussa, jotka ajoittuvat keskimmäiseltä mioseenilta Holoseenille.
- heimo Atelidae (hämähäkki, villahämähäkki, villahämähäkki ja ulvojapinat) 4 sukua, noin 19 lajia Etelä-Amerikasta pohjoiseen Meksikoon. 3 fossiililajia 2 suvussa, jotka ajoittuvat varhaiselta mioseenilta Holoseenille.
- Catarrhini (vanhan maailman apinat ja apinat) 3 elävää sukua, 5 fossiilisukua, jotka ajoittuvat Keskiseltä Eoseenilta Holoseenille. Tähän kuuluvat Victoriapithecidae, varhainen Mioseeniheimo, joka kuuluu Cercopithecoidea; Proconsulidae, varhainen Mioseeniheimo, joka kuuluu Hominoidea; ja suvut Pliopithecidae (varhainen ja keskimmäinen Mioseeni), Parapithecidae, ja Propliopithecidae (myöhäinen eoseeni ja varhainen Oligoseeni), joista yksikään ei voi sijoittaa cercopithecoidea tai Hominoidea. On olemassa useita Keski-ja Myöhäiseoseenisia sukuja, joita ei luokitella mihinkään näistä suvuista.
- yläheimo Cercopithecoidea 1 suku, jossa on 21 sukua.
- heimo Cercopithecidae (vanhan maailman apinat) 2 alaheimoa, joissa on 21 sukua ja vähintään 103 lajia, lähes kaikki Aasiasta ja Afrikasta. 17 fossiililajia 11 suvussa, jotka ajoittuvat Keskiseltä mioseenilta Holoseenille.
- Superheimo Hominoidea (apinat) 2 sukua, joissa on 6 sukua.
- heimo Hylobatidae (gibbonit) 4 sukua, noin 20 lajia. 1 eri sukuun kuuluva fossiili, joka on peräisin Pleistoseenilta.
- heimo Hominidae (suuret apinat ja ihmiset) 4 sukua, 7 afrikkalaista ja euraasialaista lajia, kunnes ihminen laajeni myöhäiseltä Pleistoseenilta lähtien. 25 fossiililajia 7 suvusta, jotka ovat peräisin Plioseenilta.
- alaheimo Ponginae (orangit) 1 suku, 3 lajia. Kaakkois-Aasia.
- alaheimo Homininae (afrikkalaiset apinat ja ihmiset) 3 sukua, 4 elävää lajia. Perinteisesti eläintieteilijät jakoivat alaheimon Homininae kahteen ”heimoon”: Gorilloihin, jotka sisälsivät gorillat, simpanssit ja bonobot ja niiden sukupuuttoon kuolleet esi-isät, ja Hominineihin, jotka sisälsivät” homininit ” eli ihmiset ja heidän sukupuuttoon kuolleet esi-isänsä. Useimmat eläintieteilijät sijoittavat nykyään kuitenkin simpanssit ja bonobot omaan heimoonsa, Panineihin, koska nämä 2 ryhmää ovat geneettisesti kauempana gorilloista kuin ihmisistä.
- yläheimo Cercopithecoidea 1 suku, jossa on 21 sukua.
- Platyrrhini (uuden maailman apinat) 5 elävää sukua, joissa on yli 93 lajia. 1 fossiiliheimo 7 myöhäisestä Oligoseenista varhaiseen Mioseenisukuun (8 lajia) ei ole luokiteltavissa mihinkään näistä suvuista.
- Infraorder Tarsiiformes 1 elävä heimo; tähän luetaan Eoseenista varhaisiin Mioseeniheimoihin Anaptomorphidae ja Omomyidae.
J. R. Napier Colin Peter Groves