osana tutkimustasi luit artikkelin, jossa mainitaan BALB / c-hiiret. Jäljität hiiren JAX® – Hiiritietokannasta ja mietit, mitä balb/c-hiirtä tutkijat käyttivät-BALB/cJ (000651) vai BALB / cByJ (001026). Mikä on ero (jos on), ja mitä sinun pitäisi käyttää tutkimuksessasi?
alajuoksut: mitä tarkoitat, etteivät ne ole kaikki samanlaisia?
aletaan vastata tähän kysymykseen käymällä lyhyesti läpi, mitä alijunat ovat. Alirasitus voi syntyä parilla tavalla: 1) kun spontaani mutaatio kiinnittyy yhdyskuntaan, ja kyseinen yhdyskunta säilyy erillisenä linjana, 2) Kun saman emoyhteisön hiiriä pidetään erillään vähintään 20 sukupolven ajan. Keskitytään toiseen suuntaan. Oletetaan, että hankimme BALB / C-hiiriä samasta lähteestä. Jos minun yhdyskuntani on lisääntynyt 11 sukupolvea, ja sinun on lisääntynyt yhdeksän sukupolvea, – meidän kaksi siirtokuntaamme ovat teknisesti toistensa alirunkoja. Miksi? Koska ne ovat 20 sukupolven (11 + 9) päässä toisistaan, ja sinä aikana on saattanut kehittyä spontaaneja mutaatioita, jotka ovat johtaneet ainutlaatuisiin fenotyyppisiin eroihin.
vastaavasti alkuperäinen BALB/c-kanta erkani kahdeksi suureksi alivoimalaitokseksi (BALB/cJ ja BALB / cByJ) jo vuonna 1935. Lisätietoja historiallisesta kehityksestä näiden kahden aliradan löytyy Potter et al. 1985 (History of the BALB / C family, Curr Topics Microbiol Immunol. 122: 1-5), the Mouse Genome Informatics website, the Origins of Inbred Mice, and in the Handbook on Genetically standardised JAX Mice. Vaikka BALB/cJ ja BALB/cByJ ovat läheistä sukua toisilleen, ne eivät ole identtisiä.
geneettiset erot tekevät kaiken eron
tunnettuja geneettisiä eroja näiden kahden substreenin välillä ovat ainakin kolme mutaatiota BALB / cByJ-kannassa: 1) Acadsdel-J (asyylikoentsyymi-a-dehydrogenaasi, lyhytketjuinen) ja 2) Ahrb-2 (aryylihiilivetyreseptori). Vaikka näitä kahta kantaa pidetään yhteensopivina suuressa Histokomplikaatiokompleksissa (MHC) (niillä on H2D-haplotyyppi) ja kudoksia voidaan siirtää kantojen välillä, luokan 1B lokus balb/cByJ: ssä sisältää deleetion Inqa-2 kromosomissa 17 (Mellor, A., et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA 82: 5920, 1985). Eri puolilla maailmaa ylläpidettävien BALB / c-alijunien väliset lisämuunnelmat löytyvät BALB / c-hiirestä. Genetiikka ja Immunologia, M. Potter (toim.), Current Topics in a Microbiology and Immunology 122, Springer-Verlag, 1985.
fenotyyppiset erot: et ole samaa rotua kuin ennen!
kuten voi olettaa kahdesta kannasta, jotka ovat lisääntyneet erikseen vuodesta 1935 lähtien, BALB/cJ: llä ja BALB / cByJ: llä on lukuisia fenotyyppisiä eroja. BALB/cByJ on parempi lisääntymiskyky ja on vähemmän aggressiivinen kuin BALB / CJ. BALB / cByJ-naaraat ovat hyviä äitejä ja niitä käytetään yleisesti sijaisäiteinä. BALB / cByJ-hiirillä on spontaani dystrofinen sydämen kalsinoosi, kohonneet vapaat rasvahapot, korkeat triglyseridiarvot ja useita hematologisia poikkeavuuksia. Muita näiden kantojen välisiä fenotyyppejä verrataan hiiren Fenomitietokannassa.
valinta ala-asemista: ja voittaja on…
nyt kun tiedätte, että balb / c: n ala-asemia on olemassa, on päätöksen aika. Viime kädessä balb/c-voimalaitteen valinta tutkimukseesi parhaiten soveltuvaksi riippuu useista tekijöistä. Jos yrität toistaa tai rakentaa aiempien kokeiden pohjalta, pyri kaikin tavoin tunnistamaan ja käyttämään samaa kantaa. Näin vältät geneettisen taustan ja fenotyypin erot. Uuden muuttujan lisääminen kokeelliseen suunnitteluun on viimeinen asia, jonka haluat tehdä. On jo tarpeeksi vaikeaa saada tilastollisesti merkittäviä tuloksia! Jos olet aloittamassa uutta tutkimuslinjaa, harkitse näiden kahden ala-aseman käyttäytymistä, jalostustehokkuutta ja dokumentoituja geneettisiä ja fenotyyppisiä ominaisuuksia.