den geologiske historie af disse krystaller begyndte for omkring 500 millioner år siden i et lavt hav, der modtog sedimenter fra de gamle Adirondack-bjerge mod nord. Calcium – og magnesiumcarbonatsedimenterne akkumuleres og lithificeres for at danne dolomitgrundfjeldet, der i øjeblikket er kendt som Little Falls Formation og tidligere som Little Falls Dolostone. Mens de blev begravet, blev hulrum dannet af surt vand, der dannede vuggerne, hvori kvartskrystallerne dannede sig. Mens dolomitenheden er Kambrisk i alderen, kvarts inden i vugs fortolkes til at have dannet sig i den Karbonholdige periode. Voksagtigt organisk materiale, silicium og pyrit (jernsulfid) var til stede som mindre bestanddele af sten fremstillet af dolomit og calcit. Da sediment begravede klippen og temperaturerne steg, voksede krystaller meget langsomt i hulrummene, hvilket resulterede i kvartskrystaller med enestående klarhed. Inklusioner kan findes i disse krystaller, der giver spor til oprindelsen af Herkimer diamanter. I indeslutningerne findes faste stoffer, væsker (saltvand eller råolie), gasser (oftest kulsyre), to – og trefaseindeslutninger og negative (enaksiale) krystaller. Et sort carbonhydrid er den mest almindelige faste inklusion.