som en del af din forskning læser du en artikel, der nævner BALB / c-mus. Du sporer den mus i databasen, og du spekulerer på, hvilken BALB/c mus forskerne brugte – BALB/cJ (000651) eller BALB/cByJ (001026). Hvad er forskellen (hvis nogen), og hvilken skal du bruge til din forskning?
Understrains: hvad mener du, at de ikke alle er ens?
lad os begynde at besvare dette spørgsmål ved kort at gennemgå, hvad understrins er. Et understrain kan opstå på et par måder: 1) når en spontan mutation bliver fikseret i en koloni, og denne koloni opretholdes som en separat linje, 2) når mus fra den samme forældrekoloni opretholdes separat i 20 generationer eller mere. Lad os fokusere på den anden vej. Antag, at du og jeg fik BALB/c-mus fra samme kilde. Hvis min koloni har avlet i 11 generationer, og din har avlet i ni generationer, er vores to kolonier teknisk set understammer af hinanden. Hvorfor? Fordi de er 20 generationer (11 + 9) fra hinanden, og i løbet af den tid kan spontane mutationer, der resulterer i unikke fænotypiske forskelle, have udviklet sig.
Tilsvarende blev den oprindelige BALB/c-stamme adskilt i to store understammer (BALB/cJ og BALB/cByJ) tilbage i 1935. Flere detaljer om den historiske udvikling af disse to understræner findes i Potter et al. 1985 (BALB/C-familiens historie, Curr emner Microbiol Immunol. 122: 1-5), musens Genominformatikhjemmeside, oprindelsen af indavlede Mus og i håndbogen om genetisk standardiserede JAKSMUS. Selvom de er nært beslægtede, er BALB/cJ og BALB / cByJ ikke identiske.
genetiske forskelle gør hele forskellen
kendte genetiske forskelle mellem disse to understriner inkluderer mindst tre mutationer i BALB / cByJ-stammen: 1) Acadsdel-J (acyl-Coensym a dehydrogenase, kort kæde) og 2) Ahrb-2 (aryl-carbonhydridreceptor). Selvom disse to stammer betragtes som matchede ved det største histokompatibilitetskompleks (MHC) (de har H2d-haplotypen), og væv kan transplanteres mellem stammer, indeholder klasse 1b-locus i BALB/cByJ en deletion inka-2 på kromosom 17 (Mellor, A., et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA 82: 5920, 1985). For yderligere variationer mellem BALB/c-understræner, der opretholdes over hele verden, se BALB / c-musen. Genetik og Immunologi, M. Potter (Red.), Aktuelle emner i en Mikrobiologi og Immunologi 122, Springer-Verlag, 1985.
fænotypiske forskelle: du er ikke den stamme, jeg kendte før!
som man kunne forvente af to stammer, der har opdrættet separat siden 1935, har BALB/cJ og BALB/cByJ adskillige fænotypiske forskelle. BALB/cByJ har en højere reproduktionsevne og er mindre aggressiv end BALB / CJ. BALB / cByJ kvinder er gode mødre og bruges ofte som plejemødre. BALB / cByJ-mus har spontan dystrofisk hjertecalcinose, forhøjede frie fedtsyrer, høje triglyceridniveauer og et antal hæmatologiske abnormiteter. Andre fænotyper mellem disse stammer sammenlignes i Musefenomdatabasen.
valg af understrins: og vinderen er…
nu hvor du ved, at understrins af BALB/c eksisterer, er det beslutningstid. I sidste ende afhænger det af en række faktorer, at du vælger, hvilken BALB/c understrain der er bedst egnet til din forskning. Hvis du prøver at gentage eller bygge videre på tidligere eksperimenter, skal du gøre alt for at identificere og bruge den samme belastning. På den måde undgår du at indføre forskelle i genetisk baggrund og fænotype. Tilføjelse af en ny variabel til dit eksperimentelle design er den sidste ting, du vil gøre. Det er allerede svært nok at få statistisk signifikante resultater! Hvis du begynder på en ny forskningslinje, skal du overveje adfærd, avlspræstation og dokumenterede genetiske og fænotypiske egenskaber ved de to understammer.