pupenů mnoha dřevin, zejména v mírném nebo chladném podnebí, je chráněn potahem z modifikované listy tzv. váhy, které pevně uzavřete jemnější části zárodku. Mnoho pupenů je pokryto gumovitou látkou, která slouží jako přidaná ochrana. Když zárodku se vyvíjí, váhy mohou poněkud zvětšit, ale obvykle jen klesat, takže řadu vodorovně protáhlé jizvy na povrchu rostoucí stonek. Pomocí těchto jizev lze určit věk jakékoli mladé větve, protože růst každého roku končí tvorbou pupenu,jehož tvorba vytváří další skupinu jizev poupěte. Pokračující růst větve způsobuje, že tyto jizvy budou po několika letech vyhlazeny, takže tímto způsobem nelze určit celkový věk starších větví.
v mnoha rostlinách se váhy netvoří nad pupenem a pupen se pak nazývá nahý pupen. Minuta nedostatečně vyvinutých listů v takových pupenech je často příliš chlupatá. Nahé pupeny se nacházejí v některé keře, jako některé druhy Škumpy a Viburnums (Kalina alnifolium a V. lantana) a bylin. V mnoha z nich jsou pupeny ještě redukovány, často sestávající z nediferencovaných hmot buněk v paždí listů. Terminální pupen se vyskytuje na konci stonku a boční pupeny se nacházejí na boku. Brassica) je mimořádně velký koncový pupen, zatímco růžičková kapusta jsou velké boční pupeny.
vzhledem k tomu, že pupeny jsou tvořeny v paždí listů, jejich rozložení na stonku je stejné jako u listů. Existují střídavé, opačné a zkroucené pupeny, stejně jako koncový pupen na špičce stonku. V mnoha rostlinách se pupeny objevují na nečekaných místech: jsou známé jako náhodné pupeny.
často je možné najít pupen v pozoruhodné sérii gradací Bud váhy. V buckeye, například, jeden může vidět kompletní gradace z malé hnědé vnější stupnice přes větší šupiny, které na rozvíjející se poněkud zelené na vnitřní váhy bud, které jsou pozoruhodně list-jako. Taková série naznačuje, že šupiny pupenu jsou v pravdě listy, upravené tak, aby chránily jemnější části rostliny během nepříznivých období.