v rámci svého výzkumu jste si přečetli článek, který zmiňuje myši BALB/c. Vypátrat, že myš v JAXI® Myši Databázi, a by vás zajímalo, které BALB/c myší vědci použili – BALB/cJ (000651) nebo BALB/cByJ (001026). Jaký je rozdíl (pokud existuje) a který z nich byste měli použít pro svůj výzkum?
Substrains: co tím myslíš, že nejsou všichni stejní?
začněme odpovědí na tuto otázku stručně přezkoumání toho, co substrains jsou. A substrain mohou nastat v několika způsoby: 1) při spontánní mutace ustálí v kolonii, a to kolonie je udržována jako samostatný řádek, 2) když myší od stejné mateřské kolonie jsou udržovány odděleně pro 20 generace nebo více. Zaměřme se na druhou cestu. Předpokládejme, že ty a já jsme získali BALB / C myši ze stejného zdroje. Pokud má kolonie byl chov 11 generací, a váš byl chov po devět generací, naše dvě kolonie jsou technicky substrains jeden druhého. Proč? Protože jsou od sebe vzdáleny 20 generací (11 + 9) a během této doby se mohly vyvinout spontánní mutace vedoucí k jedinečným fenotypovým rozdílům.
podobně se původní kmen BALB / c rozdělil na dvě hlavní substráty (BALB/cJ a BALB/cByJ) již v roce 1935. Více podrobností o historickém vývoji těchto dvou substrainů naleznete v Potter et al. 1985 (historie rodiny BALB / c, Curr témata Microbiol Immunol. 122: 1-5), webová stránka informatiky genomu myší, původ inbredních myší a v příručce o geneticky standardizovaných myších JAX. Ačkoli jsou BALB/cJ a BALB/cByJ úzce příbuzné, nejsou totožné.
Genetické rozdíly, aby všechny rozdíl
Známé genetické rozdíly mezi těmito dvěma substrains zahrnovat alespoň tři mutace v BALB/cByJ kmen: 1) Acadsdel-J (acyl-Koenzym A dehydrogenáza, krátké řetězce) a 2) Ahrb-2 (aryl-hydrocarbon receptor). Ačkoliv tyto dva kmeny jsou považovány za uzavřeno na Hlavní Histokompatibilní Komplex (MHC) (mají H2d haplotyp) a tkáně mohou být transplantovány mezi kmeny, třídy 1b locus v BALB/cByJ obsahuje smazání inQa-2 na Chromozomu 17 (Mellor, A., et al., Proc. Natle. Acad. Věda., USA 82: 5920, 1985). Pro další variace mezi BALB / C substrains udržované po celém světě viz myš BALB/C. Genetika a imunologie, m. Potter (ed.), Aktuální témata v mikrobiologii a imunologii 122, Springer-Verlag, 1985.
fenotypové rozdíly: nejsi ten kmen, kterého jsem znal!
jak můžete očekávat od dvou kmenů, které se od roku 1935 chovají odděleně, BALB / cJ a BALB / cByJ mají četné fenotypové rozdíly. BALB / cByJ má vyšší reprodukční výkon a je méně agresivní než BALB / cJ. Ženy BALB / cByJ jsou dobré matky a běžně se používají jako pěstounské matky. BALB/cByJ myši mají spontánní dystrofické srdeční kalcinóza, zvýšení volných mastných kyselin, vysoké hladiny triglyceridů, a řada hematologických abnormalit. Další fenotypy mezi těmito kmeny jsou porovnávány v databázi myších Fenomů.
Výběr substrains: a vítězem je…
Nyní, když víte, že substrains z BALB/c existují, je čas se rozhodnout. Nakonec výběr, který BALB / C substrain je nejvhodnější pro váš výzkum, závisí na řadě faktorů. Pokud se pokoušíte opakovat nebo stavět na předchozích experimentech, vynaložte veškeré úsilí na identifikaci a použití stejného kmene. Tímto způsobem se vyhnete zavedení rozdílů v genetickém pozadí a fenotypu. Přidání nové proměnné do experimentálního návrhu je to poslední, co chcete udělat. Už je dost těžké získat statisticky významné výsledky! Pokud začínáte novou linii výzkumu, zvažte chování, chov výkonnosti a doložených genetické a fenotypové vlastnosti dvou substrains.